村集体用留成地与个人签订合作开发协议是否违法，不能一概而论，需根据具体情况判断。以下从不同角度进行分析：
一、合法情形
符合土地利用规划和用途管制：
- 如果村集体的留成地符合当地的土地利用总体规划，且用途符合规定（例如，原本就规划为建设用地，或已依法办理农用地转用审批手续），那么村集体与个人签订合作开发协议，用于符合规划的建设项目，通常是合法的。
- 法律依据：根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，土地利用必须符合土地利用总体规划，且用途管制是土地管理的基本原则。
经过民主议定程序：
- 村集体在决定与个人合作开发留成地时，必须经过村民会议或村民代表会议的民主议定程序，确保决策过程公开、透明，且符合村民的意愿。
- 法律依据：根据《中华人民共和国村民委员会组织法》的相关规定，涉及村民利益的重大事项，必须经村民会议或村民代表会议讨论决定。
合作开发协议内容合法：
- 合作开发协议的内容必须合法，不得违反法律、行政法规的强制性规定，不得损害国家、集体或第三人的利益。
- 示例：协议中应明确双方的权利义务、开发项目的性质、用途、期限、收益分配等关键条款。
二、违法情形
未经批准擅自改变土地用途：
- 如果村集体的留成地原本为农用地，未经依法办理农用地转用审批手续，就擅自改变用途用于非农业建设，那么与个人签订的合作开发协议将因违反土地用途管制而无效。
- 法律后果：可能面临土地管理部门的行政处罚，甚至被追究刑事责任。
未经过民主议定程序：
- 如果村集体在决定与个人合作开发留成地时，未经过村民会议或村民代表会议的民主议定程序，那么该决策可能因违反法定程序而被撤销或确认无效。
- 法律后果：合作开发协议可能因此被认定为无效，导致双方权益受损。
合作开发协议内容违法：
- 如果合作开发协议的内容违反法律、行政法规的强制性规定，或损害国家、集体或第三人的利益，那么该协议将因违法而无效。
- 示例：协议中约定将土地非法转让给个人所有，或约定开发项目用于非法活动等。
三、建议与风险提示
在签订合作开发协议前，务必进行充分的法律尽职调查：
- 了解留成地的性质、用途、规划情况，以及是否经过民主议定程序等。
- 确保合作开发协议的内容合法、合规，且符合双方的利益需求。
咨询专业律师或法律机构：
- 在签订合作开发协议前，建议咨询专业律师或法律机构，以获取专业的法律意见和风险评估。
- 律师可以帮助审查协议条款，确保协议的合法性和有效性，并帮助双方规避潜在的法律风险。
注意保留相关证据和文件：
- 在合作开发过程中，注意保留与协议签订、履行相关的所有证据和文件，以备不时之需。
- 这些证据和文件可能在未来的纠纷解决中发挥关键作用。
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