针对您提出的“合作社退出法人不配合怎么办”这一问题，这实际上与合作社注销过程中成员不配合的情况有相似之处，我们可以借鉴处理成员不配合的思路来应对法人不配合的情况。以下是我为您提供的详细解答：
一、了解法人不配合的原因
首先，您需要主动与不配合的法人进行深入沟通，了解他们拒绝配合的具体原因。可能是法人对退出流程存在误解，担心退出后会影响其个人权益，或者对合作社的后续事务有不同意见等。通过沟通，您可以更准确地把握法人的顾虑和诉求，为后续解决问题打下基础。
二、依据合作社章程和法律法规处理
查阅合作社章程：仔细查阅合作社章程中关于法人退出、成员权利义务以及争议解决机制的条款。确保您对合作社的内部规定有全面的了解，以便在处理问题时能够依据章程进行。
遵循法律程序：如果合作社章程中没有明确规定法人退出的具体程序，或者法人不配合的行为违反了法律法规，您需要依据相关法律法规来处理。例如，可以依据《中华人民共和国农民专业合作社法》等相关法律，通过法律途径来维护合作社和其他成员的合法权益。
三、召开成员大会或成员代表大会
提前通知：按照合作社章程的规定，提前通知所有成员关于召开大会的时间、地点和议题。确保会议的合法性和有效性，让所有成员都有机会参与讨论和决策。
充分讨论：在大会上，充分讨论法人退出的问题，包括退出的必要性、合理性以及对合作社和其他成员的影响等。解答成员的疑问，争取广泛的支持和理解。
投票表决：根据合作社章程规定的表决方式和比例进行投票表决。如果大多数成员同意法人退出，那么这一决议将具有法律效力。对于不配合的法人，要明确指出其应承担的义务和可能面临的法律后果。
四、采取法律措施
发送书面通知：如果成员大会的合法决议仍无法促使不配合的法人履行义务，您可以向法人发送书面通知，明确告知其法律义务和不配合可能产生的严重后果。
提起诉讼：在必要时，以合作社的名义向有管辖权的人民法院提起诉讼，请求法院判决法人履行相关义务，并赔偿因不配合行为给合作社和其他成员造成的损失。这一步骤需要谨慎考虑，确保诉讼的必要性和合理性，并准备好充分的证据来支持您的诉求。
五、寻求外部协助
向行政主管部门反映：您可以向当地的农业农村部门等合作社行政主管部门反映情况，寻求指导和帮助。这些部门可以根据相关法律法规和政策对不配合的法人进行劝导和协调。
咨询专业机构：咨询专业的律师或会计师事务所，获取在法律和财务方面的专业意见和解决方案。他们可以帮助您更准确地把握法律条款和财务规定，确保退出流程的依法依规进行。
总结与建议：
合作社法人退出是一个复杂而敏感的过程，需要全体成员的共同努力和配合。面对不配合的法人，您应保持耐心和细心，通过沟通、协商和法律手段等多种方式解决问题。同时，充分利用合作社章程和法律赋予的权利，确保退出流程的顺利进行。在此过程中，寻求行政主管部门和专业机构的协助也是至关重要的。希望这些建议能够对您有所帮助。