当您辞去法人职务而公司不配合办理变更手续时，您可以通过以下途径来维护自己的合法权益：

一、明确法律地位与变更流程

首先，需要明确的是，法定代表人的变更并非简单的“辞职”过程，而是需要遵循法定程序进行变更登记。根据《企业法人法定代表人登记管理规定》，变更法定代表人需要向原登记机关提交免职文件、新任任职文件及变更申请书等材料。因此，您需要确保自己已经按照公司章程或相关协议的规定，向公司提出了辞职申请，并要求公司按照法定程序办理变更手续。

二、与公司及相关方沟通协商

1. 内部沟通：

   • 与股东沟通：您可以尝试与公司的股东进行沟通，说明您辞职的原因和意愿，以及继续担任法定代表人可能带来的风险和责任。通过正式的书面函件或会议形式，向股东阐述您的立场，并争取他们的理解和支持。
   • 与管理层沟通：同时，您也可以与公司的管理层进行沟通，强调变更法定代表人的必要性和重要性。您可以提出合理的解决方案，如推荐合适的新法定代表人候选人，以促使公司积极推动变更事宜。

2. 外部协助：

   • 如果公司内部无法产生合适的人选，您可以考虑推荐外部专业人士或机构，提供招聘渠道和建议，协助公司寻找接替者。

三、发出书面通知并保留证据

如果沟通无果，您可以向公司及其他股东发出正式的书面通知，明确表达您辞去法定代表人职务的意愿，并要求公司在一定期限内（如30天）办理变更登记手续。在发送通知时，建议您使用可查询投递状态的邮政特快专递（EMS）等方式寄送，并在快递单上清晰注明文件名称为“辞去法定代表人职务及要求变更通知”。同时，务必留存好通知的副本和快递底单，以备后续可能的法律纠纷之需。

四、向登记机关投诉

如果公司仍然拒绝配合办理变更手续，您可以携带辞职证明、公司章程、书面通知的送达凭证等相关文件，向公司所在地的工商行政管理部门（现市场监督管理部门）进行投诉。登记机关有权对公司进行监督和管理，并可依据相关法律法规责令公司限期改正。在投诉时，您需要详细说明公司拒绝变更法定代表人的情况，并请求登记机关介入处理。

五、提起诉讼

如果上述方法均未能解决问题，您可以考虑向有管辖权的人民法院提起诉讼，要求公司办理法定代表人变更登记手续。在提起诉讼前，您需要准备充分的证据来证明您已经向公司提出了辞职申请并要求变更，但公司拒绝配合的事实。这些证据可以包括辞职证明、公司章程、沟通记录、书面通知的送达凭证等。法院将根据双方提供的证据和陈述进行审理，并作出判决。如果公司仍不履行判决，您可以向法院申请强制执行，以确保您的权益得到最终实现。

六、特殊情况应对策略

1. 公司僵局处理：如果公司因股东矛盾等原因陷入僵局，导致无法推选新的法定代表人，您可以考虑依据《公司法》的相关规定，申请法院解散公司。但这一步骤需要谨慎评估影响，并尽可能通过其他途径解决纠纷。
2. 违法违规情况：如果您发现公司在您担任法定代表人期间存在违法行为，且这些行为可能给您带来法律责任时，您应及时向相关部门报告，以证明自己无故意参与违规行为，从而规避法律风险。

在整个过程中，您需要保持冷静和理性，遵循法律法规和公司章程的规定，通过合理的沟通和合法的手段来逐步解决问题。 如果您在处理过程中遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询，我将为您提供专业的法律帮助。