关于已经上绿牌的电动摩托车是否合法的问题，这主要取决于该电动摩托车是否符合当地的相关法规以及上牌时的具体规定。以下是一些详细的分析和解答：
首先，我们需要明确“绿牌”在不同地区的含义可能有所不同。在一些地区，如银川，绿牌通常指的是符合新国标的电动自行车，这类车辆在登记后可以正常通行。然而，在电动摩托车的语境下，绿牌可能并非直接对应电动摩托车的合法性，而是需要看该电动摩托车是否满足机动车的相关标准，并已经按照机动车的管理规定进行了登记和上牌。
车辆属性：
- 电动摩托车属于机动车范畴，必须依法按机动车进行管理。
- 这意味着电动摩托车需要满足机动车的相关标准，包括但不限于车辆性能、安全配置等。
上牌规定：
- 电动摩托车在上牌时，需要提供机动车销售统一发票等来历证明。
- 车辆必须已经通过相关部门的检验，并符合上牌条件。
- 如果电动摩托车已经按照机动车的管理规定进行了登记和上牌，那么它就是合法的，可以上道路行驶。
地区差异：
- 不同地区对于电动摩托车的上牌和管理规定可能有所不同。
- 例如，在浙江省，备案非标电动自行车（可能包括某些绿牌车辆）自特定日期起不得上道路行驶，这是为了推进非标电动车的淘汰和预防道路交通事故。
- 因此，在了解电动摩托车的合法性时，需要参考当地的具体法规和政策。
驾驶资格：
- 即使电动摩托车已经上牌，驾驶人还需要取得相应车型的驾驶证才能上道路行驶。
- 在驾驶证正式核发前，不得上道路行驶。
总结：
- 如果您所在的地区将绿牌定义为符合新国标的电动自行车，并且您的电动摩托车实际上并不符合电动自行车的标准，而是属于机动车范畴，那么仅仅上绿牌并不足以证明其合法性。您需要确保车辆已经按照机动车的管理规定进行了登记和上牌，并且驾驶人已经取得了相应车型的驾驶证。
- 另外，由于不同地区对于电动摩托车的上牌和管理规定可能有所不同，因此建议您咨询当地交通管理部门或相关机构，以获取最准确和最新的信息。
希望以上解答能够帮助您更好地理解已经上绿牌的电动摩托车的合法性问题。如果您还有其他疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询。