结论：在小区公共绿地种花被人恶意毁坏是否违法，需分情况讨论。若您在公共绿地种花的行为本身合法，那么他人恶意毁坏您的花卉则可能构成违法；反之，若您种花的行为不合法，他人毁坏行为可能不构成违法，但也可能涉及其他法律责任。以下是对此问题的详细分析：
一、您种花行为合法的情况
获得合法许可：
- 若您在小区公共绿地种花前，已获得小区物业或业主委员会的明确许可，并遵循了相应的要求和规定，那么您的种花行为是合法的。在此情况下，他人恶意毁坏您的花卉，可能构成对您的财产权的侵犯，您有权要求毁坏者承担民事赔偿责任，甚至可能涉及刑事责任（如故意毁坏财物罪，具体需根据毁坏财物的价值等因素判断）。
符合小区绿化规划：
- 若您的种花行为符合小区的整体绿化规划，且未对公共绿地造成损害或影响其他业主的正常使用，那么您的行为也是合法的。同样，他人恶意毁坏您的花卉，将承担相应的法律责任。
二、您种花行为不合法的情况
侵犯物权：
- 小区公共绿地属于全体业主共有，未经允许擅自种花可能侵犯了他人的物权。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，物权受法律保护，任何组织或个人不得侵犯。若您擅自使用公共区域种花，物权所有者或管理者（如小区物业或业主委员会）有权要求您停止侵害并恢复原状。在此情况下，他人毁坏您的花卉，虽然可能不构成对您财产权的直接侵犯（因为您的种花行为本身不合法），但毁坏行为本身若违反其他法律规定（如故意损毁公私财物），仍可能承担相应的法律责任。
违反小区管理规定：
- 许多小区都有明确的管理规定，禁止业主在公共绿地擅自种花或进行其他改变绿地用途的行为。若您违反了这些规定，小区物业或业主委员会有权要求您整改。在此情况下，他人毁坏您的花卉，同样可能不构成对您财产权的直接侵犯，但毁坏者仍需根据其行为性质承担相应的法律责任。
三、综合建议
了解并遵守相关规定：
- 在小区公共绿地种花前，务必了解并遵守小区的管理规定以及相关法律法规，确保您的行为合法合规。
与物业或业主委员会沟通：
- 若您有意在小区公共绿地种花，建议事先与小区物业或业主委员会沟通，获得他们的许可和支持。这样不仅可以避免不必要的法律纠纷，还能促进社区和谐与文明建设。
保护自身权益：
- 若您的合法种花行为遭到他人恶意毁坏，应及时收集证据（如照片、视频等），并向小区物业或业主委员会报告。必要时，您可以寻求法律帮助，维护自己的合法权益。
理性处理纠纷：
- 在处理此类纠纷时，建议保持理性与克制，通过协商、调解等和平方式解决争议。若协商无果，再考虑通过法律途径解决。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。