结论：当公司不续签劳动合同而员工不同意时，公司需根据具体情况采取相应措施，确保处理过程的合法性和合规性。以下是详细的处理指南：
一、了解员工不同意续签的原因
- 深入沟通：公司应与员工进行坦诚的沟通，了解其不愿意续签合同的具体原因。这可能涉及薪资待遇、职业发展、工作环境等多个方面。
- 分类处理：根据员工反馈的原因，公司可以判断是否属于自身原因导致员工不续签，如公司降低劳动条件等，以便后续针对性处理。
二、依法依规处理
- 提前通知：根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，公司在劳动合同期满前，应提前以书面形式通知员工是否续订劳动合同。这是确保程序合法性的重要步骤。
- 尊重员工选择：如果员工坚持不同意续签合同，公司应尊重其决定，不得强迫或变相强迫员工续签。这是保障员工自主选择权的基本原则。
- 办理离职手续：
- 结清工资：公司应在劳动合同期满后，及时为员工结清工资，确保员工的劳动报酬得到保障。
- 社保减员与档案转移：公司还需为员工办理社保减员手续，并将员工档案转移至其新单位或指定机构，以便员工后续就业和社保缴纳。
三、考虑经济补偿金支付
- 公司维持或提高劳动条件：若公司在维持或提高原劳动合同约定条件下提出续订，而员工不同意续订，公司无需支付经济补偿金。
- 公司降低劳动条件：若公司降低原劳动合同约定条件导致员工不续签，公司需按员工在本单位工作的年限支付经济补偿金。具体计算标准如下：
- 计算公式：经济补偿金 = 员工在本单位工作的年限 × 员工月工资
- 说明：每满一年支付一个月工资的标准向员工支付；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向员工支付半个月工资的经济补偿。月工资是指员工在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
四、避免违法解除劳动合同
- 不得采取不当措施：公司不得以员工不同意续签合同为由，单方面降低员工的工资待遇或采取其他不当措施迫使员工离职。这是避免违法解除劳动合同的重要原则。
- 保留证据：在整个沟通过程中，公司应注意保留相关证据，如沟通记录、通知书、离职申请表等，以备不时之需。这些证据在后续可能出现的劳动争议中具有重要作用。
五、优化人力资源管理策略
- 完善合同管理：公司应建立健全的劳动合同管理制度，明确合同签订、续签、变更、解除等流程，确保合同的合法性和有效性。这有助于减少因合同管理不善而引发的劳动争议。
- 加强员工关系管理：公司应关注员工的工作满意度和职业发展需求，及时解决员工的问题和困扰，增强员工的归属感和忠诚度。这有助于降低员工离职率，提高公司的人力资源稳定性。
- 提升法律意识：公司应加强对人力资源管理人员的法律培训，提高其法律意识和应对能力。这有助于确保在处理劳动合同问题时能够依法依规操作，避免法律风险。
后续建议：在处理此类问题时，公司应始终保持与员工的良好沟通，尊重员工的合法权益，并依法依规进行操作。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。