针对村里挖土有手续但不公示导致程序违法的情况，可按以下步骤处理：

1. 确认手续合法性及公示要求
   首先需核实村里挖土行为是否已取得合法审批手续（如《采矿许可证》《取土许可证》或临时用地审批文件等）。若手续齐全，但未依法公示，则属于程序违法。根据《行政许可法》第40条、第46条，行政机关作出准予行政许可的决定后，应当予以公开（涉及国家秘密、商业秘密或个人隐私的除外）；若涉及公共利益或利害关系人重大权益，还应通过听证、公告等方式听取意见。未公示可能侵犯村民知情权，导致程序瑕疵。

2. 收集证据并明确诉求

   • 证据收集：保留挖土现场照片、视频、审批文件复印件（如有）、未公示的证明（如村委会未张贴公告的证人证言、政府网站未公开的截图等）。
     
   • 诉求确定：根据影响程度选择诉求，例如要求停止挖土行为直至公示、撤销违法审批、赔偿因程序违法导致的损失（如土地破坏、环境污染等）。

3. 选择维权途径

   • 向审批机关提出异议：直接向颁发挖土手续的行政机关（如自然资源局、乡镇政府）提交书面异议，要求其说明未公示的理由并补办公示程序。若行政机关拒绝或未回应，可进一步采取以下措施。
     
   • 申请行政复议：根据《行政复议法》，在知道行政行为之日起60日内，向上一级行政机关（如县政府）申请复议，请求撤销或确认审批行为违法，并责令补办公示。
     
   • 提起行政诉讼：若复议未果或直接选择诉讼，可在知道行政行为之日起6个月内向法院起诉，主张审批程序违法，要求法院判决撤销审批或确认违法，并可附带提起行政赔偿（如土地修复费用）。
     
   • 向纪检监察部门举报：若存在审批机关与村委会勾结、滥用职权等违法行为，可向当地纪委监委或上级部门举报，追究相关人员责任。

4. 注意事项

   • 时效性：行政复议和诉讼均有严格期限，需尽快行动。
     
   • 专业协助：若涉及复杂法律程序或证据收集困难，可委托律师介入，提高维权效率。
     
   • 集体行动：若挖土行为影响多数村民利益，可联合其他村民共同维权，增强影响力。

总结：程序违法虽不必然导致挖土行为完全无效，但可通过法律途径要求补正程序、撤销违法审批或索赔。建议优先与审批机关沟通，若无效则及时启动复议或诉讼程序。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。