工程质量不合格，不能单纯以过保修期为由拒绝处理。以下从不同角度为你详细分析：
一、保修期的基本规定与意义
根据《建设工程质量管理条例》等相关法律法规，建设工程在正常使用条件下，不同部位有明确的最低保修期限，如基础设施工程、房屋建筑的地基基础工程和主体结构工程的保修期为设计文件规定的该工程的合理使用年限；屋面防水工程、有防水要求的卫生间、房间和外墙面的防渗漏保修期为5年等。这些保修期限是固定的，旨在保障工程在合理使用年限内的质量安全，维护建设单位和使用者的合法权益。
二、过保修期与工程质量不合格的关系
保修期内的责任：在保修期内，如果工程出现质量问题，施工单位有义务进行维修或返工，确保工程质量符合合同约定和相关标准。这是施工单位的法定义务，也是其应承担的责任。
过保修期后的责任：虽然过了保修期，但如果工程质量不合格是由于施工单位的原因造成的，如施工不当、使用不合格材料等，施工单位仍然需要承担相应的责任。这是因为工程质量不合格可能涉及安全隐患，对使用者的生命财产安全构成威胁，施工单位不能因过了保修期就免除其责任。
三、特殊情况下的处理
不可抗力因素：如果工程质量不合格是由于不可抗力因素造成的，如自然灾害（地震、洪水等）导致工程受损，且这种受损在保修期内无法预见、无法避免也无法克服，那么施工单位可能不需要承担全部责任。但这种情况需要具体分析，且施工单位需要提供充分的证据证明不可抗力因素的存在及其对工程质量的影响。
合同约定：如果建设单位和施工单位在合同中明确约定了过保修期后工程质量不合格的处理方式，如由施工单位承担一定比例的维修费用或提供其他形式的补偿，那么应按照合同约定执行。合同是双方意思自治的体现，具有法律约束力。
四、法律建议
及时沟通协商：如果发现工程质量不合格，无论是否过保修期，建设单位都应及时与施工单位沟通协商，明确责任归属和处理方式。
收集证据：建设单位应收集相关证据，如工程质量检测报告、施工记录、材料合格证明等，以证明工程质量不合格的事实和原因。
寻求法律途径：如果协商无果，建设单位可以通过法律途径维护自己的合法权益，如向法院提起诉讼或申请仲裁等。
举例说明：假设一个房屋建筑工程在保修期过后出现屋面渗漏问题，经检测发现是由于施工单位在施工时未按照规范进行防水处理导致的。虽然过了保修期，但施工单位仍然需要承担维修责任，因为工程质量不合格是由于其施工不当造成的。
综上所述，工程质量不合格不能单纯以过保修期为由拒绝处理。建设单位和施工单位应根据实际情况和合同约定，明确责任归属和处理方式，共同维护工程质量和安全。如果你有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，可以直接向我咨询。