结论：针对您提出的“开始起诉标的本金49万、利息96万，上诉只对利息部分少判的起诉即可么”这一问题，一般情况下，您可以在上诉中仅针对利息部分提出异议，但具体能否仅就利息部分上诉，还需根据一审判决的具体情况以及上诉法院的审查来确定。以下从多个角度为您详细分析：
一、上诉请求的范围
上诉请求的灵活性：在民事诉讼中，上诉人有权根据自己的意愿和一审判决的情况，选择对全部判决内容或者部分判决内容提出上诉。因此，从理论上讲，您有权仅就利息部分提出上诉。
上诉请求的明确性：然而，为了确保上诉的针对性和有效性，您需要在上诉请求中明确指出对哪一部分判决内容不服，并说明理由。如果您仅对利息部分提出上诉，那么上诉请求应当明确表述为“请求撤销一审判决中关于利息部分的判决，并依法改判”。
二、一审判决的具体情况
利息计算的合法性：在审查一审判决时，法院会关注利息的计算是否合法、合理。如果一审判决中的利息计算存在错误或者违反了相关法律法规的规定，那么您有权在上诉中提出异议，并请求法院依法改判。
利息与本金的关联性：虽然您可以选择仅就利息部分提出上诉，但法院在审查时可能会考虑利息与本金之间的关联性。如果法院认为利息的计算与本金的处理存在密切联系，那么可能会对一审判决中的本金部分也进行审查。不过，这并不意味着您必须同时对本金部分提出上诉。
三、上诉法院的审查
全面审查原则：上诉法院在审理上诉案件时，通常会遵循全面审查的原则，即对一审判决中的事实认定和法律适用进行全面审查。然而，这并不意味着上诉法院会主动对一审判决中的所有内容进行审查，而是根据上诉人的上诉请求和理由进行有针对性的审查。
尊重当事人处分权：在民事诉讼中，法院尊重当事人的处分权。如果您仅就利息部分提出上诉，那么上诉法院通常会仅就利息部分进行审查，并作出相应的判决。当然，如果上诉法院认为有必要对一审判决中的其他部分进行审查，也会在判决中说明理由。
四、实际操作建议
明确上诉请求：在准备上诉材料时，您应当明确自己的上诉请求，即仅就利息部分提出上诉，并说明理由。这有助于确保上诉的针对性和有效性。
提供充分证据：为了支持自己的上诉请求，您需要提供充分的证据来证明一审判决中的利息计算存在错误或者违反了相关法律法规的规定。这些证据可以包括借款合同、还款记录、利息计算表等。
咨询专业律师：虽然您可以自行准备上诉材料并提起上诉，但考虑到法律问题的复杂性和专业性，我建议您在上诉前咨询专业律师的意见。律师可以根据您的具体情况和一审判决的情况，为您提供有针对性的法律建议和帮助。
最后，需要提醒您的是，上诉是一项复杂的法律程序，需要耗费一定的时间和精力。因此，在决定是否上诉以及如何上诉时，请务必谨慎考虑并咨询专业律师的意见。如果您有任何疑问或者需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。