网吧实行12小时工作制一般是不合法的，以下从不同角度为你详细分析：

法律规定的工作时长

根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条规定，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。同时，该法第四十一条规定，用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。

网吧实行12小时工作制，明显超出了上述法律规定的每日工作时间上限，即使考虑加班的情况，也很难符合每月加班总时长的限制。例如，若网吧员工每天工作12小时，每周工作6天，那么每周加班时长就达到了（12 - 8）× 6 = 24小时，一个月按4周计算，加班时长就高达96小时，远远超过了每月36小时的加班上限。

特殊工时制度的适用

虽然存在综合计算工时工作制和不定时工作制这两种特殊工时制度，但网吧行业一般并不属于适用这些特殊工时制度的典型行业。综合计算工时工作制是针对因工作性质特殊，需连续作业或受季节及自然条件限制的企业的部分职工，采用以周、月、季、年等为周期综合计算工作时间的一种工时制度。不定时工作制则是针对因生产特点、工作特殊需要或职责范围的关系，无法按标准工作时间衡量或需要机动作业的职工所采用的一种工时制度。

网吧的工作通常并不具备这些特殊性质，因此不能随意采用特殊工时制度来延长员工的工作时间。如果网吧要实行特殊工时制度，需要经过劳动行政部门的审批，并且要保障劳动者的休息休假权利和身体健康。

违法后果

如果网吧实行12小时工作制被认定为违法，可能会面临一系列的法律后果。根据《劳动保障监察条例》第二十五条规定，用人单位违反劳动保障法律、法规或者规章延长劳动者工作时间的，由劳动保障行政部门给予警告，责令限期改正，并可以按照受侵害的劳动者每人100元以上500元以下的标准计算，处以罚款。

此外，网吧还需要向员工支付加班费。根据《劳动法》第四十四条规定，安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。如果网吧未按照规定支付加班费，员工还可以通过劳动仲裁等方式维护自己的合法权益。

建议：如果你是网吧员工，遇到网吧实行12小时工作制的情况，可以先与网吧进行协商，要求其遵守法律规定，合理安排工作时间并支付相应的加班费。如果协商无果，你可以向当地的劳动保障监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。如果你有其他疑问，欢迎直接向我咨询。