公司收取滞纳金是否合法，需根据具体情况来判断。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、基本原则与法律规定
劳动合同法相关规定：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位在招用劳动者时，不得要求劳动者提供担保或者以其他名义向劳动者收取财物。虽然该条款直接提及的是“押金”和“担保”，但“以其他名义向劳动者收取财物”这一表述具有广泛的涵盖性，原则上也可能包括不合理的滞纳金。
滞纳金性质：
- 滞纳金通常是对未按时履行义务（如未按时支付工资、未按时完成工作任务等）的一种经济惩罚。然而，在劳动关系中，公司单方面设定滞纳金并收取，可能缺乏法律依据，尤其是当滞纳金金额过高或收取方式不合理时。
二、合法与非法收取滞纳金的情形
非法收取滞纳金：
- 如果公司未经劳动者同意，单方面设定滞纳金并收取，或者滞纳金金额过高、收取方式不合理（如未提前告知、未提供书面协议等），则这种行为可能违反法律规定。劳动者有权拒绝支付，并可以通过与公司协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁等途径维护自身权益。
合法收取滞纳金（极少数情况）：
- 在极少数情况下，如果公司和劳动者双方在劳动合同或相关协议中明确约定了滞纳金的收取条件、金额和方式，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么公司收取滞纳金可能是合法的。但这种情况较为罕见，且需要严格的法律审查和书面协议支持。
三、劳动者应对措施
与公司协商：
- 如果劳动者认为公司收取的滞纳金不合理或违法，首先可以尝试与公司进行协商，要求公司解释滞纳金的收取依据和合理性，并寻求解决方案。
向劳动监察部门投诉：
- 如果协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉。劳动监察部门有权对公司进行调查，并责令公司限期退还非法收取的滞纳金，同时可能对公司处以罚款。
申请劳动仲裁：
- 作为更进一步的法律手段，劳动者还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。通过法律程序要求公司退还非法收取的滞纳金，并可主张相应的赔偿。
四、法律建议
- 对于公司：建议公司在设定和收取滞纳金时，务必遵守相关法律法规的规定，确保滞纳金的收取条件、金额和方式合法合理，并与劳动者签订书面协议进行明确约定。
- 对于劳动者：建议劳动者在签订劳动合同时，仔细阅读合同条款，了解公司是否设定了滞纳金以及滞纳金的收取条件、金额和方式。如果发现公司存在非法收取滞纳金的行为，应及时采取措施维护自身权益。
总结来说，公司收取滞纳金是否合法，需根据具体情况和法律法规来判断。在大多数情况下，公司单方面设定并收取滞纳金可能违反法律规定。如果劳动者遇到此类问题，建议及时与公司协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁以维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。