结论：已取得房产证的二手房业主限制买方使用公积金贷款的行为，其合法性需分情况讨论，不能一概而论。

1. 若合同无特别约定，业主限制公积金贷款可能构成违约
   在二手房交易中，买卖双方的权利义务通常由购房合同约定。若合同中未明确限制买方贷款方式（如仅允许商业贷款），业主单方面拒绝买方使用公积金贷款，可能违反《民法典》第509条规定的“全面履行合同义务”原则。公积金贷款是法定购房融资方式之一，买方有权选择，业主无正当理由拒绝可能需承担违约责任（如赔偿买方差价损失、诉讼费用等）。

2. 若合同明确约定贷款方式，业主限制可能合法
   若购房合同中明确约定“买方须通过商业贷款支付房款”，或约定“业主有权拒绝公积金贷款”，则该条款对双方具有约束力。此时业主的限制行为属于合同自由范畴，不违法。但需注意：

   • 条款需为双方真实意思表示，不存在欺诈、胁迫等情形；
     
   • 条款内容需明确具体，避免模糊表述导致争议。

3. 业主限制公积金贷款的常见合理理由
   即使合同未明确约定，业主也可能基于以下理由主张限制合法：

   • 公积金贷款流程较长：公积金贷款需经公积金管理中心审批，流程通常比商业贷款慢1-2个月，业主可能因急于回笼资金而拒绝；
     
   • 贷款额度限制：公积金贷款有最高额度限制（如部分城市单职工最高60万），若房款超过额度，买方需组合贷款或补足差价，业主可能担心交易风险；
     
   • 买方资质问题：若买方公积金缴存年限、余额等不符合贷款条件，业主可能要求改用商业贷款。
     但需注意：业主需举证证明其限制行为与上述理由存在直接关联，否则仍可能被认定为违约。

4. 买方应对建议

   • 签约前：在合同中明确约定贷款方式（如“买方有权选择公积金贷款或商业贷款”），并约定业主拒绝的违约责任（如“业主拒绝公积金贷款的，需按房款5%支付违约金”）；
     
   • 签约后：若业主无正当理由拒绝公积金贷款，买方可先协商，协商不成可向法院起诉，要求业主继续履行合同或赔偿损失；
     
   • 特殊情形：若因政策调整导致公积金贷款无法办理（如当地公积金中心暂停贷款），买方需及时通知业主，并协商变更付款方式或解除合同。

总结：业主限制公积金贷款的合法性取决于合同约定及限制理由的合理性。建议买卖双方在签约时明确贷款方式，避免纠纷；若已产生争议，可依据合同条款及实际情况主张权利。如有具体案件细节，可进一步向我咨询。