结论：工程未经验收，建设单位擅自使用后未进行结算，是否需要赔偿施工单位损失，需根据具体情况判断，但建设单位擅自使用未经验收工程的行为，通常需承担一定责任，且可能影响结算及损失赔偿的认定。以下从不同角度详细分析：

一、建设单位擅自使用未经验收工程的法律责任

根据《中华人民共和国民法典》及相关司法解释，建设工程竣工后，建设单位应组织设计、施工、工程监理等有关单位进行竣工验收。若建设单位未经竣工验收擅自使用工程，自其实际使用之日起，即应视为对工程质量的认可，此后若出现质量问题，除地基基础工程和主体结构质量问题外，建设单位一般需自行承担责任。

举例说明：如某工程未经验收，建设单位即投入使用，后因墙面开裂等问题与施工单位产生纠纷。若开裂非地基基础或主体结构问题，且建设单位无法证明问题系施工原因导致，则法院可能认定建设单位自行承担修复费用。

二、未进行结算的法律后果

结算系建设单位与施工单位就工程价款进行确认的过程。若工程未经验收，建设单位擅自使用后未进行结算，施工单位仍有权要求结算工程价款。此时，结算的金额可能因工程是否合格、是否存在质量问题等因素而受到影响。

1. 若工程经后续验收合格：建设单位应按合同约定支付工程价款，包括可能因工期延误等产生的违约金或损失赔偿（若合同有约定且施工单位存在过错）。
2. 若工程存在质量问题：建设单位可在结算时扣除相应修复费用或要求施工单位承担修复责任。但如前所述，若质量问题非地基基础或主体结构问题，且建设单位已擅自使用工程，则其自行承担部分或全部修复费用的风险增加。

三、损失赔偿的认定

关于建设单位是否需要赔偿施工单位损失，需根据具体损失类型及因果关系判断：

1. 若施工单位因建设单位擅自使用工程导致额外损失（如因建设单位急于使用而要求施工单位加快施工进度，导致施工单位增加人工、材料等成本），且该损失与建设单位行为存在直接因果关系，则施工单位有权要求建设单位赔偿。
2. 若损失系施工单位自身原因导致（如施工质量问题、工期延误等），则建设单位无需赔偿，且可能反诉施工单位承担违约责任。

四、法律建议

1. 对建设单位：应严格遵守法律法规，组织竣工验收后再使用工程，避免因擅自使用而承担不必要的法律责任。同时，应及时与施工单位进行结算，明确工程价款及可能的质量问题处理方式。
2. 对施工单位：应保留好施工过程中的相关证据（如施工记录、验收申请等），以便在发生纠纷时证明自身权益。若因建设单位擅自使用工程导致损失，应及时收集证据并主张赔偿。

如有具体法律问题或需要进一步分析，请直接向我咨询。我将结合您的具体情况，提供更详细的法律建议。