自建房打桩请第三方检测机构是合法的。以下从多个角度为你详细分析：

法律背景与依据

在自建房的建设过程中，确保建筑质量和安全是至关重要的。打桩作为自建房建设的基础工程，其质量直接关系到整个建筑物的稳定性和安全性。为了保障打桩质量，业主有权选择并委托具有相应资质的第三方检测机构对打桩工程进行检测。这一行为不仅符合建筑行业的常规做法，也符合相关法律法规的规定。

第三方检测机构的合法性

1. 资质要求：第三方检测机构必须具备相应的检测资质和认证，这是其合法从事检测活动的基础。业主在选择检测机构时，应核实其资质证书和业务范围，确保检测机构具备对打桩工程进行检测的能力和资格。
2. 合同关系：业主与第三方检测机构之间应签订书面检测合同，明确双方的权利和义务。合同中应包含检测项目、检测标准、检测方法、检测费用等关键条款，以确保检测活动的合法性和有效性。

实际操作中的注意事项

1. 选择正规机构：业主在选择第三方检测机构时，应优先选择具有良好信誉和口碑的正规机构。可以通过查询相关资质证书、了解机构历史业绩、咨询行业专家等方式进行核实。
2. 明确检测标准：在签订检测合同时，业主应与检测机构明确检测标准和检测方法。这有助于确保检测结果的准确性和可靠性，也为后续可能出现的纠纷提供有力的证据支持。
3. 监督检测过程：业主有权对检测过程进行监督，确保检测机构按照合同约定的标准和程序进行检测。如果发现检测机构存在违规行为或检测结果不准确的情况，业主应及时提出异议并要求重新检测。

可能的法律后果

如果业主未委托第三方检测机构对打桩工程进行检测，或者检测机构存在违规行为导致检测结果不准确，可能会引发一系列法律后果。例如，如果打桩工程存在质量问题导致建筑物倒塌或损坏，业主可能需要承担相应的赔偿责任；如果检测机构因违规行为被行政处罚或承担民事责任，业主也可能因此受到牵连。

建议与总结

为了确保自建房打桩工程的质量和安全，业主应积极委托具有相应资质的第三方检测机构进行检测。在选择检测机构时，应注重机构的资质、信誉和口碑；在签订检测合同时，应明确检测标准和检测方法；在检测过程中，应积极监督检测机构的检测行为。如果遇到任何法律问题或纠纷，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议和帮助。