在涉税案件已进入司法程序的情况下，确实存在限制法人出境的可能性，但具体是否会被限制，需依据案件的具体情况、相关法律规定以及司法机关的判断来决定。以下从不同角度为你详细分析：
法律依据与原则
出境限制的法律依据：
- 根据《中华人民共和国出境入境管理法》第十二条的规定，中国公民有未了结的民事案件，人民法院可以决定不准其出境。这一规定同样适用于法人代表或实际控制人等关键人员，在涉税案件等经济纠纷中，若法人被认定为关键人员且案件未了结，可能面临出境限制。
- 此外，《中华人民共和国税收征收管理法》第四十四条也规定，欠缴税款的纳税人或者他的法定代表人需要出境的，应当在出境前向税务机关结清应纳税款、滞纳金或者提供担保。未结清税款、滞纳金，又不提供担保的，税务机关可以通知出境管理机关阻止其出境。
出境限制的原则：
- 出境限制通常基于保护国家利益、社会公共利益或案件审理的需要。在涉税案件中，若法人出境可能影响案件的审理、税款的追缴或国家税收秩序，司法机关或税务机关可能会决定限制其出境。
限制出境的具体情形
案件性质与严重程度：
- 若涉税案件涉及重大税款逃避、偷税漏税等违法行为，且案件性质严重、影响恶劣，司法机关或税务机关更可能决定限制法人出境，以确保案件的顺利审理和税款的追缴。
法人的角色与责任：
- 若法人在涉税案件中扮演关键角色，如直接负责税务申报、税款缴纳等，且存在明显的违法行为或过错，其出境可能被视为逃避法律责任的行为，从而面临出境限制。
案件进展与司法程序：
- 在涉税案件已进入司法程序的情况下，若案件尚未审结或存在未执行的判决、裁定等，法人出境可能影响案件的进一步审理或执行，因此也可能面临出境限制。
限制出境的程序与救济
限制出境的程序：
- 限制法人出境通常需要由司法机关或税务机关依法作出决定，并通知出境管理机关执行。在决定限制出境前，相关机关通常会进行充分的调查和评估，确保决定的合法性和合理性。
法人的救济途径：
- 若法人认为限制出境的决定存在错误或不当，可以依法向相关机关提出异议或申请复议。在复议期间，限制出境的决定通常不会停止执行，但法人可以提供担保等方式申请暂时解除限制。
实际建议
- 积极配合调查与审理：在涉税案件中，法人应积极配合司法机关或税务机关的调查和审理工作，如实提供相关证据和信息，以争取从轻处理或避免不必要的出境限制。
- 及时结清税款与滞纳金：若法人存在欠缴税款或滞纳金的情况，应及时结清以避免出境限制。若确实无法一次性结清，可以与税务机关协商提供担保等方式解决。
- 寻求专业法律帮助：在面对涉税案件和出境限制等问题时，法人可以寻求专业律师的帮助，了解相关法律规定和程序，制定合理的应对策略。
总之，涉税案件已进入司法程序时，法人是否会被限制出境需依据具体情况和相关法律规定来判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。