针对您提出的“父亲和儿子两个户口法院查不到，需要配合但村委会不配合是否违法”的问题，我们可以从法律义务和村委会的角色两个方面来详细分析。

首先，关于法院查询户口的问题，如果法院在执行公务或进行相关法律程序时，需要查询某个人的户口信息，这是法院依法行使职权的一部分。在此情况下，相关单位和个人，包括村委会，都有义务配合法院的工作，提供必要的协助和信息。

接下来，我们重点讨论村委会不配合的情况。根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，有关基层组织和所在单位代表，如受送达人住所地的居民委员会和村民委员会的工作人员，有义务协助法院进行送达等工作。这意味着，当法院需要村委会协助查询户口信息或进行其他法律程序时，村委会应当积极配合，提供必要的帮助。

如果村委会拒绝配合法院的工作，这可能构成对法律义务的违反。虽然村委会作为基层自治组织，有其独立的运作方式和考虑，但在法律面前，所有单位和个人都必须遵守法律，履行法律义务。村委会不配合法院的工作，不仅可能影响法院的正常执法，还可能对当事人的合法权益造成损害。

此外，从实际案例来看，如孝昌某村委会协助法院给被告送达开庭传票的案例，就充分说明了村委会配合法院工作的重要性。在该案例中，村委会的积极配合不仅促进了案件的顺利解决，还避免了双方对簿公堂，节省了诉讼成本，提高了纠纷解决的效率。

因此，针对您提出的问题，如果村委会在法院需要查询户口信息或进行其他法律程序时拒绝配合，这确实可能构成违法。在这种情况下，您可以向法院反映情况，要求法院采取相应措施，确保法律程序的顺利进行。同时，也可以考虑通过法律途径维护自己的合法权益。

总的来说，村委会作为基层自治组织，在法律面前有义务配合法院的工作。如果村委会不配合，不仅可能违反法律义务，还可能对当事人的合法权益造成损害。因此，我们应当尊重法律，履行法律义务，共同维护社会的法治秩序。