自动离职是否要扣工资，需视具体情况而定，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：

一、合法自动离职的情况

如果员工按照《劳动合同法》的规定，提前三十日以书面形式通知用人单位（在试用期内提前三日），可以解除劳动合同。这种情况下，员工自动离职是合法的，用人单位无权扣减工资。工资是员工提供劳动后应得的报酬，只要员工已经付出了劳动，用人单位就应当按照约定支付工资。

法律依据：

• 《劳动合同法》第三十七条：“劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。”

二、违法自动离职的情况

如果员工没有按照法律规定提前通知用人单位，而是擅自离职，这可能构成违法解除劳动合同。然而，即使在这种情况下，用人单位也无权随意扣减工资。工资是员工劳动的对价，用人单位应当按照员工实际工作的天数和约定的工资标准支付工资。

但需注意：

• 如果员工的违法离职行为给用人单位造成了经济损失，用人单位可以要求员工赔偿损失。不过，这种赔偿应当限于员工违法离职行为直接造成的损失，并且用人单位需要承担举证责任，证明损失的存在以及损失与员工违法离职行为之间的因果关系。
• 赔偿金额的计算：通常，赔偿金额不会超过员工当月工资的20%，并且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。如果用人单位主张的赔偿金额超过了这个限度，或者无法提供充分的证据证明损失的存在和因果关系，那么其扣减工资的行为可能被视为违法。

法律依据：

• 《工资支付暂行规定》第十六条：“因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。”

三、实际操作中的建议

1. 对于员工：在离职前，最好与用人单位进行沟通，了解离职的具体流程和注意事项，确保自己的离职行为合法合规。如果确实需要自动离职，也应当尽量提前通知用人单位，以减少可能带来的不利影响。
2. 对于用人单位：在面对员工自动离职的情况时，应当保持冷静和理性，依法处理工资支付和损失赔偿等问题。如果员工确实存在违法离职行为并给用人单位造成了损失，用人单位可以通过合法途径要求员工赔偿损失，但不得随意扣减工资。

总结来说，自动离职是否要扣工资取决于离职的合法性以及是否给用人单位造成了经济损失。在处理这类问题时，建议双方都保持冷静和理性，依法维护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。