员工在哺乳期协议解除劳动合同是否合规，需分情况讨论：
若协议解除系双方自愿且合法：
- 法律依据：根据《劳动合同法》第三十六条，用人单位与劳动者协商一致，可以解除劳动合同。这意味着，如果哺乳期女职工与用人单位在平等、自愿的基础上，就解除劳动合同达成一致，且该协议不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，那么该协议解除是合法的。
- 实际操作：在实际操作中，双方应签订书面的解除劳动合同协议，明确解除的原因、时间、经济补偿等条款，以确保协议的合法性和有效性。同时，用人单位应确保女职工在解除劳动合同后，能够依法享受相应的社会保险待遇和福利待遇。
若协议解除存在违法情形：
- 违法情形：如果用人单位在协议解除过程中，存在欺诈、胁迫、乘人之危等情形，或者违反法律、行政法规的强制性规定，如未支付经济补偿、未依法为女职工缴纳社会保险等，那么该协议解除是违法的。
- 法律后果：根据《劳动合同法》第四十八条，用人单位违反本法规定解除或者终止劳动合同，劳动者要求继续履行劳动合同的，用人单位应当继续履行；劳动者不要求继续履行劳动合同或者劳动合同已经不能继续履行的，用人单位应当依照本法第八十七条规定支付赔偿金。对于哺乳期女职工，用人单位的违法解除行为还可能面临更严厉的法律制裁。
特殊保护情形：
- 法律依据：根据《劳动合同法》第四十二条，女职工在孕期、产期、哺乳期的，用人单位不得依照本法第四十条、第四十一条的规定解除劳动合同。这意味着，在正常情况下，用人单位不得单方面解除与哺乳期女职工的劳动合同。
- 例外情况：然而，如果哺乳期女职工存在严重违反用人单位的规章制度、严重失职、营私舞弊给用人单位造成重大损害等情形，用人单位仍然可以依据《劳动合同法》第三十九条的规定解除劳动合同。但这种情况下的解除，必须基于女职工的过错行为，且用人单位需要承担举证责任。
建议：
- 对于哺乳期女职工而言，如果面临用人单位提出的协议解除劳动合同，应谨慎考虑并咨询专业律师的意见，以确保自己的合法权益不受侵害。
- 对于用人单位而言，在解除与哺乳期女职工的劳动合同时，应严格遵守法律法规的规定，确保解除行为的合法性和合规性。同时，也应积极与女职工进行沟通协商，以达成双方都能接受的解决方案。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。