渔政部门以船证不符为由不给年检，并且不告知改正方法或后续处理措施，这种行为可能涉及违法，具体分析如下：

1. 行政行为的合法性原则：

   • 行政机关在行使职权时，必须遵循合法性原则，即其行为必须有明确的法律依据，且程序合法。渔政部门作为行政机关，其拒绝年检的行为应当有明确的法规支持，并且应当告知相对人（即船主）具体的法律依据和改正方法。
   • 如果渔政部门仅以“船证不符”为由拒绝年检，却未提供具体的法规依据或改正指导，这可能违反了行政行为的合法性原则，特别是程序合法性的要求。

2. 行政相对人的知情权：

   • 行政相对人（船主）在面对行政机关的行政行为时，享有知情权，即有权了解行政行为的依据、理由以及后续处理措施。
   • 渔政部门拒绝年检且不告知改正方法或后续处理措施，剥夺了船主的知情权，使得船主无法有效行使自己的权利，如申请复议或提起诉讼等。

3. 可能的法律后果：

   • 如果渔政部门的行为确实违反了相关法律法规，船主有权向上一级行政机关申请复议，或者向人民法院提起诉讼，要求撤销或变更渔政部门的行政行为。
   • 在复议或诉讼过程中，渔政部门需要承担举证责任，证明其拒绝年检的行为有明确的法律依据且程序合法。如果渔政部门无法提供充分证据，其行政行为可能被撤销或变更。

4. 建议与行动：

   • 收集证据：船主应首先收集与渔政部门拒绝年检相关的所有证据，包括拒绝年检的通知、船证不符的具体情况说明（如果有）、与渔政部门的沟通记录等。
   • 咨询专业意见：在收集证据后，船主可以咨询专业律师，了解自己的权利和义务，以及可能的法律途径和后果。
   • 申请复议或提起诉讼：如果船主认为渔政部门的行为确实违法，且侵犯了自己的合法权益，可以向上一级行政机关申请复议，或者向人民法院提起诉讼。

总结来说，渔政部门以船证不符为由不给年检，并且不告知改正方法或后续处理措施，这种行为可能违反了行政行为的合法性原则和行政相对人的知情权。船主有权通过合法途径维护自己的权益，包括申请复议或提起诉讼。如果你遇到类似情况，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的法律建议。