在破产管理人发现应对公司承担赔偿责任的股东对公司亦享有债权的情况下，通常的处理方式是进行债权债务的抵销，但需严格遵循法定条件和程序。以下从不同角度进行详细分析：

一、债权债务抵销的法律依据与条件

根据《中华人民共和国企业破产法》及相关司法解释，债权债务的抵销在破产程序中是允许的，但必须满足以下条件：

1. 双方互负债务：即股东对公司负有赔偿责任（债务），同时公司对股东享有债权。
2. 债务种类相同：通常要求是金钱债务，以便于计算和抵销。
3. 无禁止抵销情形：如债务人的债务人在破产申请受理后取得他人对债务人的债权的，不得抵销；或者债务人的股东主张以下列债务与债务人对其负有的债务抵销，债务人管理人提出异议的，人民法院应予支持：
   • 债务人股东因欠缴债务人的出资或者抽逃出资对债务人所负的债务；
   • 债务人股东滥用股东权利或者关联关系损害公司利益对债务人所负的债务。

二、破产管理人的处理流程

1. 审查债权债务：破产管理人首先需要审查股东对公司的赔偿责任以及公司对股东的债权是否真实存在，且符合抵销条件。
2. 通知与异议：如果破产管理人认为可以抵销，应当通知相关股东，并告知其有权提出异议。股东在收到通知后，如果认为抵销不合法或存在其他争议，可以向破产管理人提出异议。
3. 处理异议：破产管理人收到异议后，应当进行审查，并作出是否抵销的决定。如果破产管理人坚持抵销，而股东仍有异议，股东可以向人民法院提起诉讼，请求确认抵销无效。
4. 执行抵销：在无异议或异议被驳回后，破产管理人可以执行债权债务的抵销，将股东对公司的赔偿责任与公司对股东的债权进行相抵。

三、特殊情况下的处理

1. 股东恶意取得债权：如果股东在破产申请受理后，通过不正当手段取得对公司债权，意图通过抵销来逃避赔偿责任，这种抵销是不被允许的。破产管理人应当拒绝抵销，并可以依法追究股东的法律责任。
2. 债权债务性质不符：如果股东对公司的赔偿责任与公司对股东的债权性质不符（如一个是金钱债务，一个是非金钱债务），则无法进行抵销。此时，破产管理人应当分别处理这两种债权债务，按照法定程序进行清偿或追偿。

四、法律后果与风险提示

1. 合法抵销的法律后果：如果债权债务抵销合法有效，那么股东对公司的赔偿责任将被视为已经履行，同时公司对股东的债权也将被视为已经清偿。这有助于简化破产程序，提高清偿效率。
2. 非法抵销的法律风险：如果破产管理人或股东违反法定条件和程序进行抵销，可能面临法律制裁和赔偿责任。例如，破产管理人可能因滥用职权或疏忽大意而承担法律责任；股东可能因恶意取得债权或违反诚信原则而承担赔偿责任。

总结与建议：在处理此类问题时，破产管理人应当严格遵循法定条件和程序进行债权债务的抵销，确保破产程序的公正、公平和高效进行。同时，股东也应当积极配合破产管理人的工作，如实申报债权债务情况，避免恶意取得债权或违反诚信原则的行为发生。如果您在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。