结论：房主本人不在时，代签租房合同是否合法需根据具体情况判断。在有合法授权委托或构成表见代理的情况下，代签行为是有效的；未经授权或授权存在瑕疵的代签行为则可能导致合同效力待定或无效。
一、合法的授权代签
授权形式与要件：
- 房主可以通过书面授权明确授予代理人代理权。书面授权书应详细载明代理人的姓名/名称、代理事项（即代为签订租房合同）、具体权限和代理期限，并由房主本人签名或盖章，以确保其法律效力。
- 在紧急或特殊情况下，口头授权也可能被接受，但为避免后续纠纷，建议优先选择书面授权形式。
合同效力：
- 当代理人拥有合法授权时，其所代签的租房合同对房主具有完全的法律约束力。这意味着房主需按合同约定履行义务，如提供符合约定的租赁物、保证租赁物的正常使用等，并享受相应权利，如收取租金等。
- 若租客基于该代签合同支付了费用或定金，而房主事后以不知情为由否认合同，租客有权凭借有效的授权证明要求房主履行合同；若房主拒绝，则构成违约，租客可追究其违约责任。
二、构成表见代理的无授权代签
情形说明：
- 若虽无直接授权，但存在使租客有合理理由相信代理人有代理权的情形，如代理人持有房主的身份证复印件、房产证复印件，或房主以往默认该代理人处理租房事宜等，此时代签可能构成表见代理。
合同效力：
- 在表见代理下，代签的合同视为有效，对房主产生法律约束力。房主需按合同约定履行义务，并享受相应权利。
三、无权或瑕疵代签
情形说明：
- 若代理人未获房主授权，或授权存在瑕疵（如授权书内容不明确、授权期限已过、伪造授权委托书等），则代签行为属于无权代理。
合同效力与后果：
- 此时，合同的效力待定。房主事后追认，则合同生效；房主拒绝追认，则合同对房主不发生效力。
- 若因此导致合同无效，且租客已支付定金或其他费用，代理人需向租客返还相关款项，并赔偿因其无权代理行为给租客造成的损失。
四、实际操作与法律风险防范建议
- 代理人：在代签租房合同时，应出示有效的身份证明及授权委托书，以供租客核实其身份和代理权限。同时，应确保授权委托书的内容真实、准确、完整，避免因授权瑕疵导致合同无效。
- 租客：在签订合同前，应仔细核对代理人的身份信息及授权文件的真实性，确保代签行为的合法性。对于任何疑问或不确定之处，应及时向房主或代理人求证，或咨询专业律师意见。
- 房主：若因故无法亲自签署合同，应尽量通过书面形式明确授权代理人代为签订，并详细列明委托事项、权限及期限。同时，应保持与代理人的沟通联系，及时了解合同签订情况，避免因信息不对称导致纠纷。
总结：房主本人不在时，代签租房合同的合法性取决于是否存在合法授权或构成表见代理。为确保合同的合法性和有效性，建议各方在签订合同时严格遵守法律规定，谨慎行事，并在必要时寻求专业法律咨询。如果你有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，可以直接向我咨询。