公司通过劳务派遣公司代发工资的行为本身是合法的，但需满足特定条件且存在一定限制。以下从不同角度展开分析：

1. 合法性基础
   根据《劳动合同法》第五十九条，劳务派遣单位（用人单位）应当履行对劳动者的义务，包括支付劳动报酬。若公司（用工单位）与劳务派遣公司签订合法协议，明确约定由派遣公司代发工资，且派遣公司具备合法资质（如人力资源服务许可证、劳务派遣经营许可证），则该行为不违反法律规定。

2. 需满足的核心条件

   • 协议明确性：公司与派遣公司的合作协议中需清晰约定工资代发条款，包括支付时间、方式、金额核算标准等，避免责任推诿。
     
   • 劳动者知情权：劳动者需在劳动合同中明确知晓工资由派遣公司发放，且实际发放金额、时间需与约定一致。若公司隐瞒代发事实或克扣工资，可能涉嫌违法。
     
   • 派遣公司合规性：派遣公司需具备独立承担民事责任的能力，且无拖欠工资、偷逃税费等违法记录，否则公司可能因选任过失承担连带责任。

3. 潜在风险与限制

   • 同工同酬问题：若公司通过派遣公司发放工资以规避“同工同酬”义务（如给派遣员工低于正式员工的薪资），可能违反《劳动合同法》第六十三条，面临行政处罚或劳动者索赔。
     
   • 社保缴纳责任：派遣公司需为劳动者缴纳社保，若公司要求派遣公司不缴或少缴以降低成本，可能涉及社保欺诈，双方均需承担法律责任。
     
   • 劳动者维权路径：若发生工资纠纷，劳动者可同时起诉派遣公司和公司，要求承担连带责任（《劳动合同法》第九十二条），公司可能因此卷入诉讼。

4. 实务建议

   • 公司角度：若选择代发工资，需严格审查派遣公司资质，在协议中明确工资核算规则、违约责任，并定期监督派遣公司发放情况。
     
   • 劳动者角度：签订劳动合同时需仔细阅读条款，确认工资发放主体及金额，保留工资条、银行流水等证据，若发现权益受损可向劳动监察部门投诉或申请仲裁。

总结：代发工资行为合法，但公司需确保程序合规、协议完善，并避免以代发为名损害劳动者权益。如有具体操作疑问或纠纷，可进一步向我咨询细节。