当您面临农村自留地被侵占的问题时，为了有效维护自身合法权益，您可以遵循以下合法维权步骤，并收集相应的证据来支持您的主张：
一、明确占地情况与收集权属证明
确认土地权属：
- 首先，您需要核实被占用的土地确实属于您的自留地。这可以通过查阅自留地使用权证、土地承包经营合同或村集体分配记录（如台账、会议记录）等文件来确认。
收集权属证明文件：
- 自留地使用权证：这是最直接证明您对自留地拥有合法使用权的文件。
- 土地承包经营合同：合同中应明确土地的四至边界、面积、使用期限等关键信息。
- 村集体分配记录：这些记录可以证明自留地的分配情况，进一步巩固您的权属证明。
二、收集侵权事实证据
现场证据：
- 照片和视频：高清拍摄自留地的整体状况、被侵占的位置以及侵占过程。在照片和视频上标注时间、地点等信息，以增加证据的可信度。
- 土地现状图：绘制详细的地图，标注原始边界、被侵占后的实际边界以及标志性地物，如树木、建筑物等。
证人证言：
- 邻居和村集体成员：他们可能了解自留地的历史和现状，可以提供书面记录或出庭作证，支持您的主张。
其他书面证据：
- 相关协议或合同：如果涉及自留地的租赁、流转等协议，这些文件可以证明土地的使用和流转情况。
- 通讯记录：与侵占方或相关人员的沟通记录，特别是那些包含承认侵占、协商解决等关键信息的记录。
- 财产损失证明：如农作物受损清单、预期收益评估报告等，这些文件可以证明因侵占导致的经济损失。
三、尝试沟通与协商
与占用方沟通：
- 主动与占用方联系，了解其占用原因和意图。在沟通过程中，明确提出您对土地的合法权益，并要求对方停止占用并恢复土地原状。
- 保留聊天记录、通话录音等证据，以备后续维权之需。
达成书面协议：
- 如果双方能够达成一致，建议签订书面协议，明确双方的权利和义务。这可以确保您的权益得到法律保障。
四、寻求基层组织调解
申请基层组织介入：
- 如果协商无果，您可以向村民委员会或乡镇政府等基层组织申请调解。这些机构熟悉当地情况，具有一定的权威性和公信力，有助于协调解决纠纷。
提供详细情况：
- 向基层组织反映问题时，详细说明土地被占的情况、与占用方的沟通过程及结果，并提交相关证据材料。这有助于基层组织更好地了解真实情况并开展调解工作。
五、运用法律途径维权
行政复议与诉讼：
- 如果您认为政府征收行为违法（如程序不合法、补偿不合理），可以在规定期限内向上一级行政机关申请行政复议。对复议结果不满意或不愿经过复议程序，可以直接向人民法院提起行政诉讼。
民事诉讼：
- 对于私人或企业非法占用土地的行为，在与对方协商不成、基层组织调解无果的情况下，您可以向人民法院提起民事诉讼。要求侵权方停止侵权行为并赔偿经济损失。在诉讼过程中，准备充分的证据材料以支持您的主张。
农业主管部门调解与仲裁：
- 您还可以考虑向县级以上人民政府农业农村主管部门申请调解处理。或者根据土地承包仲裁委员会的仲裁结果进行维权。对仲裁结果不服的，同样可以向人民法院提起诉讼。
六、注意事项
- 合法性：确保所有证据的收集方式合法，不侵犯他人隐私或违反法律法规。
- 真实性：确保证据内容真实可靠，无伪造或篡改。
- 完整性：形成完整的证据链，涵盖权属证明、侵权事实、损失证明等多个方面。
- 专业协助：在维权过程中，寻求专业律师的帮助以确保法律手段的正确运用和维权策略的有效性。
- 证据保全：必要时向人民法院申请证据保全，防止关键证据被破坏或丢失。
通过遵循以上步骤和收集相应的证据，您可以有效维护自身在农村自留地被侵占问题上的合法权益。