两个小区由一个物业提供服务但投票分开投，是否合理需分情况讨论，具体分析如下：

1. 若两个小区在法律上属于独立的物业管理区域
   根据《物业管理条例》及相关地方性法规，物业管理区域的划分通常以土地使用权证范围、规划许可证范围或业主共同决定为准。若两个小区在规划、产权或业主大会决议中明确为独立区域（例如存在围墙、门禁等物理隔离，且共用设施设备较少），则它们应分别成立业主大会、独立选举业委会，并由业主共同决定物业服务合同续签、专项维修资金使用等重大事项。此时，投票分开进行符合法律规定，因为每个区域的业主仅对其共有部分和共同管理事项享有表决权。

2. 若两个小区在法律上属于同一物业管理区域
   若两个小区在规划或产权上属于同一区域（例如共用主要设施设备、出入口或管理用房），且未通过法定程序分割为独立区域，则它们应视为一个整体成立业主大会。此时，涉及全体业主共同利益的事项（如选聘物业服务企业、制定管理规约）需由全体业主共同投票决定，投票应合并进行。若物业或部分业主擅自分开投票，可能侵犯其他业主的表决权，导致决议效力存疑。

3. 特殊情形：业主共同决定分开投票
   即使两个小区属于同一物业管理区域，若业主大会通过合法程序（如双过半业主同意）决定对部分事项分开投票（例如一个小区要求增设监控，另一个小区反对），且该决定不违反法律强制性规定（如不损害其他业主共有权益），则可能被认可。但此类情形需严格遵循业主大会议事规则，并确保程序公正透明。

建议行动：

• 核实两个小区的物业管理区域划分依据（如规划许可证、业主大会决议）；
  
• 若存在争议，可向当地房管部门申请查阅物业管理区域备案资料；
  
• 若发现投票程序违法（如未提前公告、伪造选票），可向街道办或房管部门投诉，或通过业主大会决议撤销原决定。
  

如有进一步细节（如小区是否共用设施、投票事项具体内容），可继续向我咨询，我会结合具体法规为您分析。