刑法修正案在适用时确实遵循从旧兼从轻原则。这一原则在刑法适用中具有重要意义，它旨在平衡法的稳定性与公正性，确保公民权利得到保障，并体现刑法有利于被告人的精神。以下是对这一原则的详细解释：

一、从旧兼从轻原则的含义

从旧兼从轻原则，指的是在刑法溯及力问题上，原则上应适用行为时的法律（即旧法），但如果新法对行为人更为有利（即不认为是犯罪或处刑较轻），则应适用新法。这一原则既体现了对犯罪嫌疑人或被告人权益的特别保护，又彰显了法律适用的公平性和人道主义精神。

二、从旧兼从轻原则在刑法修正案中的具体适用

1. 原刑法不认为是犯罪，刑法修正案认为是犯罪的：

   • 在这种情况下，应遵循“从旧”原则，即适用原刑法规定，刑法修正案不具有溯及力。这是因为公民在行为时依据的是当时的法律，若事后因法律修改而被追究刑事责任，将违背法的稳定性和公民的合理预期。

2. 原刑法认为是犯罪，但刑法修正案不认为是犯罪的：

   • 对于此类行为，如果案件尚未经过审判或判决尚未生效，则应适用“从轻”原则，即按照刑法修正案的规定处理，此时刑法修正案具有溯及力。这体现了刑法对被告人权益的特别保护。

3. 原刑法和刑法修正案都认为是犯罪：

   • 在这种情况下，应比较两部法律对同一行为规定的处罚轻重，并选择适用处罚较轻的规定。这既符合“从轻”原则，也体现了刑法的公正性和人道主义精神。

三、从旧兼从轻原则的法律依据

《中华人民共和国刑法》第十二条明确规定了从旧兼从轻原则的具体内容和条件，为这一原则在司法实践中的应用提供了明确的法律依据。该条款规定：“中华人民共和国成立以后本法施行以前的行为，如果当时的法律不认为是犯罪的，适用当时的法律；如果当时的法律认为是犯罪的，依照本法总则第四章第八节的规定应当追诉的，按照当时的法律追究刑事责任，但是如果本法不认为是犯罪或者处刑较轻的，适用本法。本法施行以前，依照当时的法律已经作出的生效判决，继续有效。”

四、从旧兼从轻原则的意义与应用

1. 法律稳定性与可预测性：从旧兼从轻原则首先强调了法律的稳定性，确保人们能够依据行为时的法律来预测自己的行为后果。这有助于维护社会秩序和公众对法律的信任。

2. 权益保护与公平性：通过适用对行为人更有利的新法，从旧兼从轻原则体现了对犯罪嫌疑人或被告人合法权益的保护，避免了因法律变更而导致的不公平处罚。

3. 法律权威与社会和谐：坚持从旧兼从轻原则有助于维护法律的权威性和社会的稳定和谐。它表明法律不仅关注惩罚犯罪，更注重保护人权和公平正义的实现。

总结与建议：

刑法修正案在适用时遵循从旧兼从轻原则，这是刑法适用中的一项重要原则。在司法实践中，法院会综合考虑案件的具体情况，严格遵循这一原则，以确保判决的公正性、合理性和可接受性。如果您在刑法适用方面遇到任何问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问，我将根据您的具体情况提供详细的法律解答和建议。