若己方在交通事故中负主责，但认为交警处理事故程序违法，可按以下步骤处理：

1. 收集并固定程序违法证据
   首先需明确交警程序违法的具体情形，例如：

   • 未在法定期限内出具《事故责任认定书》（一般应在现场调查后10日内制作）；
     
   • 未依法履行告知义务（如未告知当事人申请复核的权利）；
     
   • 现场勘查程序违规（如未按规定拍照、测量、绘制现场图）；
     
   • 证据收集不合法（如未依法询问证人、扣押物品未出具凭证）。
     建议：立即通过拍照、录音、书面记录等方式固定证据，并要求交警部门出具书面说明或补正程序。

2. 通过行政复议或行政诉讼救济

   • 行政复议：自收到《事故责任认定书》之日起3日内，向上一级公安机关交通管理部门提出书面复核申请，重点说明程序违法事实及法律依据（如《道路交通事故处理程序规定》第71条）。
     
   • 行政诉讼：若复核未获支持，可在知道程序违法之日起6个月内，以交警部门为被告向法院提起行政诉讼，请求撤销或变更认定书（依据《行政诉讼法》第12条、第46条）。
     注意：行政诉讼需证明程序违法与责任认定结果存在因果关系，建议委托律师协助梳理证据链。

3. 在民事赔偿中主张程序违法的影响
   若程序违法导致责任认定显失公平（如将本应次责认定为主责），可在后续民事诉讼中：

   • 向法院申请调取交警卷宗，证明程序瑕疵；
     
   • 引用《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》第24条，主张责任认定书不应作为定案依据；
     
   • 要求法院结合其他证据（如行车记录仪、证人证言）重新划分责任比例。
     案例参考：某法院曾因交警未依法询问关键证人，未采纳责任认定书，最终按7:3比例改判赔偿。

4. 向纪检监察部门投诉
   若交警存在故意违法（如收受贿赂、徇私舞弊），可向公安机关督察部门（12389）或纪检监察机关实名举报，要求调查处理。
   提示：投诉需提供具体线索（如时间、地点、涉事人员），避免仅凭主观猜测。

行动建议：

1. 立即整理所有与事故相关的材料（认定书、现场照片、沟通记录等）；
   
2. 咨询律师评估程序违法是否影响责任认定结果；
   
3. 根据律师意见选择复议、诉讼或投诉路径，优先通过行政程序解决（成本较低、效率较高）。
   

如有进一步疑问或需协助梳理证据，可直接向我提问。