业主自治申请书通常需要业主签字并按手印，但具体是否必须签字按手印，需结合实际情况判断。以下从不同角度进行分析：

1. 从法律效力的角度
   业主自治申请书本质上是业主共同意思表示的载体，其核心在于证明业主对自治事项的真实意愿。根据《民法典》相关规定，民事法律行为可以采用书面形式、口头形式或其他形式。书面形式中，签字或盖章是常见的确认方式。按手印并非法律强制要求，但签字+按手印的组合能最大限度强化证据效力，尤其在涉及重大权益（如物业费调整、公共区域改造）时，可避免因签字真实性争议导致申请无效。

2. 从实践操作的角度

   • 若申请书需提交给政府部门或法院（如申请成立业主大会、备案自治章程），通常要求业主签字并按手印，以确保文件真实性。
     
   • 若申请书仅用于内部协商（如业主间沟通自治方案），可简化形式，但建议仍保留签字，以明确责任主体。
     
   • 若业主无法签字（如文盲、残疾），可按手印替代签字，但需附上身份证明或见证人说明。

3. 从风险防范的角度
   若申请书涉及重大决策（如选聘物业公司、动用维修基金），强烈建议业主签字并按手印，并附上身份证复印件。实践中曾出现因签字不清晰、代签等问题导致申请被驳回的案例，按手印可有效降低此类风险。

建议：

• 优先采用“签字+按手印”的组合形式，尤其是涉及公共利益或可能引发争议的事项。
  
• 若业主对按手印有顾虑（如隐私担忧），可仅签字，但需确保签字清晰可辨，并保留业主身份证明。
  
• 具体要求可咨询当地房管部门或居委会，以符合地方性法规或政策。
  

如有其他细节需要进一步分析（如申请书内容、自治事项类型），可随时向我补充说明。