关于您提出的“房贷第二天凌晨扣款的算逾期吗”这一问题，这主要取决于您贷款银行的具体规定。以下是我为您详细分析的情况：
首先，我们需要明确的是，房贷的还款时间节点通常由贷款银行来设定，并且这一设定可能会因银行的不同而有所差异。在大多数情况下，银行会在还款日当天进行多次自动扣款操作，这些操作可能分布在凌晨、下午或晚上等不同时段。
自动扣款情况分析：
- 如果您的银行在还款日当天有多次自动扣款，并且第二次或后续的扣款时间是在第二天凌晨，那么只要这次扣款成功，并且是在银行规定的还款期限内完成的，通常就不会被视为逾期。但这里有一个关键点，就是您需要确保在银行进行最末次自动扣款前，账户内有足够的资金以供扣款。
- 然而，也有少数银行规定，如果首次扣款失败（比如因为账户余额不足），即使后续补充了资金并完成了扣款，仍然会被判定为逾期。这种情况下，第二天凌晨的扣款就可能会被视为逾期，如果它是在首次扣款失败之后进行的。
主动还款与宽限期：
- 如果您选择通过网上银行、手机银行等渠道进行主动还款，那么您需要特别注意银行规定的还款截止时间。这个时间可能是还款日当天的24点、下午5点或晚上8点等，具体因银行而异。如果您在这个时间之前完成了还款，就不会被视为逾期。
- 另外，有些银行会设定一个还款宽限期，通常在还款日后2至3天内。如果您在这个宽限期内还清了欠款，同样不会被视为逾期。但即便如此，我也建议您尽量在还款日前还清应还金额，以避免任何潜在的风险。
如何确保避免逾期：
- 为了确保避免逾期，我建议您首先仔细查阅您的贷款合同。合同中通常会明确列出具体的还款时间要求和逾期判定标准。
- 如果您对合同中的任何条款有疑问或不明确的地方，我建议您直接联系您的贷款经办银行或客服部门。他们可以为您提供最准确的还款信息和逾期规定。
综上所述，房贷第二天凌晨扣款的是否算逾期，主要取决于您贷款银行的具体规定。为了确保您的个人信用记录不受影响，我建议您提前了解并遵循银行规定的还款时间和逾期标准，并尽量在还款日前确保账户内有足够的资金以供扣款。如果您有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时联系您的贷款银行或客服部门。