结论：辞职时扣工资并要求签字盖章的行为是否合法，需根据具体情况判断，若扣工资无合法依据，则该行为不合法。以下从不同角度详细分析：
一、合法扣工资的情形
根据《工资支付暂行规定》等相关法律法规，用人单位在特定情况下可以合法扣除劳动者工资，主要包括：
- 代扣代缴费用：如个人所得税、社会保险费用等，用人单位可以依法从劳动者工资中扣除。
- 赔偿经济损失：因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
- 法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费：用人单位可以依法从劳动者工资中扣除。
若辞职时扣工资属于上述合法情形之一，且扣除金额、程序等均符合法律规定，那么要求劳动者签字盖章确认是合法的。这种情况下，签字盖章是对扣工资行为的确认，表明劳动者知晓并同意扣除。
二、非法扣工资的情形
若用人单位扣工资无合法依据，如：
- 无故克扣工资：用人单位无正当理由扣减劳动者应得工资。
- 超出法定限额扣除：如因劳动者原因造成损失，但扣除金额超过劳动者当月工资的20%，或扣除后剩余工资低于当地最低工资标准。
- 以其他名义非法扣除：如以罚款、保证金等名义扣除劳动者工资。
若辞职时扣工资属于上述非法情形之一，那么要求劳动者签字盖章确认也是不合法的。这种情况下，签字盖章可能被视为劳动者对非法行为的被迫认可，但这种认可并不具有法律效力。劳动者有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求用人单位支付被扣的工资及相应的经济补偿。
三、劳动者应对策略
- 了解法律规定：劳动者应了解自己的工资权益及用人单位可以合法扣除工资的情形，以便在辞职时判断扣工资是否合法。
- 保留证据：如工资条、劳动合同、辞职通知等，以便在发生纠纷时证明自己的主张。
- 协商解决：若对扣工资有异议，可与用人单位协商解决，要求用人单位提供扣工资的合法依据及计算方式。
- 投诉或仲裁：若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
建议：在辞职时，若用人单位提出扣工资并要求签字盖章，劳动者应谨慎对待。首先判断扣工资是否合法，若合法且同意扣除，可签字盖章确认；若非法或不同意扣除，应拒绝签字盖章，并保留好相关证据，以便后续维权。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。