结论前置：劳动仲裁中，加班证明只有公司公章没有领导签字，一般来说是有效的，但具体效力需结合其他证据和案件具体情况综合判断。

详细分析：

1. 公章的法律效力：

   • 公司公章是公司对外表示其意思表示的重要工具，具有法律效力。在劳动仲裁中，如果加班证明上加盖了公司公章，这通常意味着公司对该加班事实的认可。
   • 公章的使用代表公司行为，而非个人行为，因此即使没有领导签字，只要公章真实有效，该加班证明在形式上就是合法的。

2. 领导签字的非必要性：

   • 领导签字并非加班证明有效的必要条件。虽然领导签字可能增加证明的可信度，但并非所有情况下都需要领导签字。
   • 在实际操作中，由于公司规模、管理流程等因素，可能并非所有加班证明都会经过领导签字。因此，不能仅凭没有领导签字就否定加班证明的有效性。

3. 综合判断加班证明的有效性：

   • 除了公章外，劳动仲裁机构还会考虑其他证据来综合判断加班证明的有效性。例如，加班记录、考勤表、工资单、同事证言等。
   • 如果加班证明上的内容与其他证据相互印证，形成完整的证据链，那么即使没有领导签字，该加班证明也可能被认定为有效。
   • 反之，如果加班证明存在瑕疵或与其他证据相矛盾，那么即使加盖了公司公章，其有效性也可能受到质疑。

4. 特殊情况下的处理：

   • 如果公司能够证明公章被滥用或加班证明存在伪造、变造等情况，那么该加班证明可能被认定为无效。
   • 在这种情况下，公司需要提供充分的证据来支持其主张，如公章使用记录、监控录像、证人证言等。

法律建议：

• 对于劳动者而言，在提交加班证明时，应尽量确保证明上加盖了公司公章，并保留好其他相关证据，如加班记录、考勤表等，以形成完整的证据链。
• 对于公司而言，应加强对公章的管理和使用，避免公章被滥用或盗用。同时，在劳动仲裁中，如果公司对加班证明的真实性有异议，应及时提供充分的证据来支持其主张。

后续行动指导：

• 如果您在劳动仲裁中遇到了加班证明有效性的问题，建议您根据上述分析，结合自己的具体情况，准备充分的证据来支持自己的主张。
• 如有需要，您可以随时向我咨询，我会根据您的具体情况提供更详细的法律建议和指导。