在建设工程合同纠纷的二审程序中，新证据和代理意见均扮演着至关重要的角色，它们对于案件的走向和最终判决结果可能产生决定性影响。以下是对这两者在二审中作用的详细分析：
新证据的作用
影响事实认定：
- 二审中的新证据，如果被法院采纳，可能直接改变一审法院对案件事实的认定。例如，在建设工程合同纠纷中，如果一审时未能提供完整的工程变更记录或结算文件，而二审时提供了这些关键证据，可能直接影响到工程价款的计算和责任划分。
改变法律适用：
- 新证据的出现有时也可能导致法院对法律适用的重新考量。例如，如果新证据揭示了合同中的某些条款存在歧义或未明确约定，法院可能需要根据新的证据来重新解释合同条款，进而适用不同的法律规定。
影响判决结果：
- 最终，新证据可能直接改变二审的判决结果。如果新证据足以推翻一审判决中的关键事实或法律适用，二审法院可能会撤销原判，发回重审或直接改判。
注意事项：
- 根据《民事诉讼法》及相关司法解释，二审中的新证据通常指的是在一审庭审结束后新发现的证据，或者因客观原因无法在一审期间提供，经人民法院准许，在延长的期限内仍无法提供的证据。
- 提交新证据时，需确保其真实性、合法性和关联性，并按照法院的要求进行举证和质证。
代理意见的作用
阐述法律观点：
- 代理意见是律师或代理人对案件法律问题的全面阐述，它有助于二审法院更全面地了解案件的法律背景和争议焦点。在建设工程合同纠纷中，代理意见可以详细分析合同条款、工程进度、质量标准、价款结算等关键问题，并提出相应的法律观点和主张。
反驳对方观点：
- 代理意见也是反驳对方观点和论据的重要工具。通过代理意见，律师可以针对对方提出的证据和论点进行逐一反驳，提出相反的证据和理由，以维护己方当事人的合法权益。
影响法官心证：
- 优秀的代理意见能够影响法官的心证，使法官更加倾向于采纳己方的观点和主张。在二审中，由于案件已经经过一审的审理，法官对案件事实和法律问题已经有了一定的了解。因此，代理意见需要更加精炼、有力，能够直击要害，打动法官。
建议：
- 在撰写代理意见时，应注重逻辑性和条理性，确保观点明确、论据充分、论证严密。
- 同时，代理意见也应结合案件的具体情况和相关法律法规进行撰写，避免泛泛而谈或脱离实际。
总结来说，在建设工程合同纠纷的二审程序中，新证据和代理意见都是至关重要的。新证据可能改变案件事实认定和法律适用，进而影响判决结果；而代理意见则有助于阐述法律观点、反驳对方观点并影响法官心证。因此，在二审程序中，当事人应充分重视新证据的收集和提交以及代理意见的撰写和提交工作。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。