劳动合同上的公章与离职协议书的公章不一样，离职协议书是否生效，需分情况讨论：

1. 公章真实但不同：

   • 如果劳动合同和离职协议书上的公章都是真实的，但属于不同部门或不同时期的公章（例如，公司因业务需要刻制了多枚公章，或公司名称变更后更换了新公章），这并不影响离职协议书的法律效力。关键在于公章的真实性和使用公司的授权。只要离职协议书是双方真实意思表示，且内容合法，那么该协议书就是有效的。

2. 存在伪造或盗用公章：

   • 如果离职协议书上的公章是伪造的，或者被未经授权的人员盗用，那么该协议书可能因缺乏真实的意思表示或违反法律强制性规定而无效。在这种情况下，你需要收集证据证明公章的伪造或盗用事实，如报警记录、公章鉴定报告等，以维护自己的合法权益。

3. 公司合并、分立或名称变更：

   • 如果公司在签订离职协议书前后发生了合并、分立或名称变更等情形，导致公章发生变化，那么只要离职协议书是在公司变更后签订的，且使用了新公司的公章，或者虽然使用了旧公章但得到了新公司的追认，那么该协议书仍然是有效的。

法律建议：

• 核实公章真实性：如果你对离职协议书上的公章真实性有疑问，可以要求公司提供公章的备案证明或进行公章鉴定。
• 收集证据：如果怀疑公章被伪造或盗用，应立即报警并收集相关证据，如聊天记录、邮件往来等，以证明自己并未签署该协议或签署时存在欺诈、胁迫等情形。
• 咨询专业律师：在处理此类纠纷时，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议。律师可以根据你的具体情况分析离职协议书的法律效力，并帮助你制定合适的维权策略。

可能后果：

• 如果离职协议书被认定有效，那么你需要按照协议书的约定履行自己的义务，如办理离职手续、支付违约金等。
• 如果离职协议书被认定无效或可撤销，那么你可以根据实际情况要求公司重新协商离职事宜或寻求其他法律救济途径。

总之，离职协议书的法律效力取决于公章的真实性、使用公司的授权以及协议书的内容是否合法等因素。如果你对此有疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。