结论：实际施工人以被挂靠公司名义与第三人签订的买卖合同中约定的管辖条款，一般不直接适用实际施工人，但具体是否适用还需结合合同签订情况、实际施工人与被挂靠公司的关系以及案件具体情况等因素综合判断。以下从不同角度进行分析：
一、合同相对性原则
基本原则：根据合同相对性原则，合同中的管辖条款通常只约束合同双方当事人，即被挂靠公司和第三人。实际施工人并非该买卖合同的直接当事人，因此，从合同相对性的角度来看，管辖条款一般不直接适用于实际施工人。
例外情况：如果实际施工人与被挂靠公司之间存在明确的约定，或者实际施工人以某种方式参与了合同的签订或履行，且该约定或行为足以使第三人相信实际施工人也是合同的一方当事人，那么在实际施工人与第三人之间可能产生合同上的权利义务关系，此时管辖条款的适用性可能会受到影响。但这种情况较为特殊，需要具体案件具体分析。
二、实际施工人与被挂靠公司的关系
内部关系：实际施工人与被挂靠公司之间通常存在内部挂靠关系，这种关系并不直接对外产生法律效力。因此，在对外签订的买卖合同中，被挂靠公司作为合同的一方当事人，其签订的管辖条款一般只约束被挂靠公司和第三人。
表见代理或职务行为：如果实际施工人的行为构成表见代理或职务行为，即第三人有理由相信实际施工人具有代表被挂靠公司签订合同的权限，那么在实际施工人与第三人之间可能产生合同上的权利义务关系。但即便如此，管辖条款的适用性仍然需要具体分析，因为表见代理或职务行为主要解决的是合同效力问题，而非管辖问题。
三、案件具体情况
合同签订情况：如果买卖合同是由实际施工人直接以被挂靠公司的名义与第三人签订的，且合同中明确约定了管辖条款，那么该条款一般只约束被挂靠公司和第三人。但如果实际施工人在合同签订过程中起到了关键作用，且第三人对此明知或应知，那么在实际施工人与第三人之间可能因合同关系而产生管辖上的争议。
合同履行情况：如果实际施工人实际参与了合同的履行，如交付货物、接收货款等，且这些行为与管辖条款的适用有直接关联，那么在实际施工人与第三人之间可能因合同履行而产生管辖上的争议。但这种情况同样需要具体案件具体分析，因为合同履行情况并不直接决定管辖条款的适用性。
四、法律建议
明确合同主体：在签订买卖合同时，应明确合同主体，避免实际施工人以被挂靠公司的名义签订合同而引发管辖上的争议。
完善内部约定：实际施工人与被挂靠公司之间应完善内部约定，明确双方在合同签订、履行过程中的权利义务关系，以及因合同产生的纠纷的解决方式。
及时咨询律师：如果在实际操作中遇到管辖上的争议或疑问，应及时咨询专业律师，以便根据具体情况制定合适的法律策略。
总结：实际施工人以被挂靠公司名义与第三人签订的买卖合同中约定的管辖条款，一般不直接适用实际施工人。但具体是否适用还需结合合同签订情况、实际施工人与被挂靠公司的关系以及案件具体情况等因素综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。