自然人名字变更后，在公司股东中的变更需通过修改公司章程、股东名册及办理工商变更登记来完成。具体流程和要点如下：

1. 修改公司章程
   公司章程是公司治理的核心文件，需明确记载股东姓名或名称。自然人股东变更姓名后，应召开股东会（或股东大会），形成修改公司章程的决议，将原股东姓名更新为新姓名。
   法律依据：根据《公司法》第二十五条，有限责任公司章程应载明股东姓名或名称；第八十一条，股份有限公司章程应载明发起人姓名或名称。章程修改需经代表三分之二以上表决权的股东通过（有限责任公司）或出席会议的股东所持表决权的三分之二以上通过（股份有限公司）。

2. 更新股东名册
   公司需制作股东名册，记载股东姓名、出资额、出资证明书编号等信息。股东姓名变更后，公司应在股东名册中将原姓名替换为新姓名，并由公司法定代表人签字或盖章确认。
   法律依据：根据《公司法》第三十二条，股东名册是确认股东资格的依据，股东姓名变更后，公司有义务更新名册。

3. 办理工商变更登记
   完成章程修改和股东名册更新后，公司需向市场监督管理部门申请变更登记，提交以下材料：

   • 股东会决议（或股东大会决议）；
     
   • 修改后的公司章程或章程修正案；
     
   • 股东身份证明（如身份证、户口本等，证明姓名变更事实）；
     
   • 公司营业执照副本。
     法律依据：根据《公司登记管理条例》第二十七条，公司变更股东姓名的，应当自变更决议或决定作出之日起30日内申请变更登记。

4. 注意事项

   • 时间限制：公司需在股东姓名变更后30日内完成工商变更登记，逾期可能面临行政处罚；
     
   • 其他股东权益：姓名变更不影响股东的出资义务、分红权等权益，但需确保公司内部文件（如出资证明书、股权转让协议等）中的姓名一致；
     
   • 税务处理：若姓名变更涉及股权转让（如同时变更持股比例），需按税务规定缴纳印花税或个人所得税；若仅姓名变更，无需额外税务处理。

建议：为避免后续纠纷，建议自然人股东在姓名变更后及时通知公司，并配合完成上述流程。若公司拖延办理，股东可依据《公司法》或章程规定，通过法律途径要求公司履行义务。如有具体操作疑问，可进一步向我咨询。