非法采伐石料后再加工成石子，犯罪数额的认定需结合非法采矿罪的定罪量刑标准，以非法开采的矿产品价值或销售金额为核心依据，具体分以下情形认定：

1. 以非法开采的矿产品价值认定

根据《刑法》第三百四十三条及《最高人民法院、最高人民检察院关于办理非法采矿、破坏性采矿刑事案件适用法律若干问题的解释》（法释〔2016〕25号）第三条，非法采矿罪的犯罪数额通常以非法开采的矿产品价值计算。具体规则如下：

• 价值认定依据：
  若非法开采的矿产品（包括原石料及加工后的石子）未销售，价值按照省级人民政府国土资源主管部门出具的鉴定结论，结合市场价格核算；若已销售，则按实际销售金额认定。
• 加工行为的影响：
  加工行为本身不改变矿产品的属性，原石料与加工后的石子均属于非法开采的矿产品范畴。因此，犯罪数额应包括全部矿产品的价值，而非仅计算加工后的增值部分。例如，若非法采伐石料价值10万元，加工后石子销售金额为15万元，犯罪数额仍以10万元（或鉴定价值）为准，但销售金额可作为量刑参考。

2. 以销售金额认定（特殊情形）

若非法开采的矿产品已全部销售，且无证据证明实际开采量或价值，可按实际销售金额认定犯罪数额。但需注意：

• 证据要求：需有完整的销售记录、合同、转账凭证等证据证明销售金额的真实性。
• 例外情形：若销售金额明显低于市场价值，可能被认定为“以明显低价销售”，此时仍需以鉴定价值为准。

3. 量刑情节的关联认定

犯罪数额的认定直接影响量刑，但需结合其他情节综合判断：

• 数额巨大标准：
  根据司法解释，非法采矿价值10万元至30万元以上的，属于“情节严重”；100万元至300万元以上的，属于“情节特别严重”。具体标准由各省根据经济水平细化。
• 加工行为的量刑影响：
  若加工行为涉及其他违法（如未取得环评许可、占用农用地等），可能构成数罪并罚或从重处罚情节，但不影响犯罪数额的认定。

4. 实务中的争议点

• 矿产品价值的鉴定：
  若原石料与加工后的石子价值差异较大（如原石料价值低但加工后附加值高），部分地区可能对“矿产品价值”的认定存在分歧。此时需结合立法目的（打击非法开采行为）主张以原矿价值为准。
• 共同犯罪中的数额分担：
  若存在多人分工（如采伐、运输、加工、销售），犯罪数额通常按共同犯罪总额认定，而非个人分得金额。

建议：若涉及具体案件，需结合开采量、销售记录、鉴定报告等证据综合分析，并关注当地司法解释的细化标准。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体法律问题。