结论前置：长期租赁土地合同超过二十年的部分，根据法律规定是自动失效的，但前二十年的租赁关系仍然有效。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据
根据《中华人民共和国民法典》第七百零五条的规定：“租赁期限不得超过二十年。超过二十年的，超过部分无效。”这一条款明确规定了租赁合同的期限限制，即无论何种类型的租赁合同，其租赁期限均不得超过二十年，超过的部分在法律上是无效的。
二、合同有效性分析
一般租赁合同：
- 对于一般的土地租赁合同，如果租期约定为超过二十年，那么超出二十年的部分在法律上是无效的。这意味着，如果合同租期为三十年，那么后十年的租赁关系在法律上是不被承认的，但前二十年的租赁关系仍然有效。
土地承包合同：
- 需要注意的是，土地承包合同与一般的租赁合同在期限规定上存在差异。根据《中华人民共和国农村土地承包法》的规定，耕地的承包期为三十年，草地的承包期为三十年至五十年，林地的承包期为三十年至七十年。这些规定体现了法律对土地承包经营权的特殊保护。
- 因此，在土地承包合同中，如果合同期限超过了二十年，但并未超过上述法定最长期限，且符合其他有效条件（如主体适格、意思表示真实、不违反法律法规强制性规定等），则合同仍然是有效的。
三、超过二十年部分的处理
合同部分无效：
- 对于超过二十年的部分，由于法律明确规定其无效，因此这部分租赁关系在法律上是不被承认的。双方当事人无需继续履行超过二十年的部分，承租人也无需支付剩余租金。
财产返还与折价补偿：
- 如果承租人对土地进行了改善或增添附属设施使土地增值，出租人应根据公平原则给予适当折价补偿。同时，在租赁期限届满二十年后，若双方未达成新的有效协议，承租人应返还土地，并确保土地处于合理使用后的状态。
过错赔偿责任：
- 如合同超过二十年部分无效是由一方过错导致，该方应赔偿对方因此遭受的损失。例如，出租人明知租赁期限限制却故意签订长期合同，应承担赔偿责任。若双方均有过错，则应根据过错程度分担损失。
四、建议与注意事项
签订合同时注意期限：
- 在签订土地租赁合同时，双方应明确约定租赁期限，并确保不超过法律规定的二十年限制。如果希望延长租赁期限，可以在合同中约定续订条款，当二十年租期届满时，双方可以根据实际情况协商续订租赁合同。
了解土地承包合同的特殊规定：
- 如果涉及土地承包合同，应了解并遵守《中华人民共和国农村土地承包法》的相关规定，特别是关于承包期限的规定。
咨询专业律师：
- 在签订或履行土地租赁合同时，如有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。作为专业律师，我将根据您的具体情况提供详细的法律分析和建议。
综上所述，长期租赁土地合同超过二十年的部分在法律上是无效的，但前二十年的租赁关系仍然有效。双方在签订合同时应注意期限限制，并了解土地承包合同的特殊规定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。