结论：电信公司在住宅区商铺建机房是否合法，需根据具体情况判断，主要涉及规划许可、产权人同意、环保及安全要求等关键因素。以下从不同角度详细分析：
1. 规划许可与用途变更
- 核心依据：根据《城乡规划法》及地方规划管理条例，建筑物用途变更（如商铺改为机房）需经规划部门审批。若原商铺规划用途不包含通信设施，电信公司需申请变更用途并取得《建设工程规划许可证》。
- 例外情形：若机房属于微型基站（如5G微站），且符合地方“通信基础设施共建共享”政策，可能适用简化审批流程，但仍需确保不违反建筑结构安全要求。
2. 产权人同意与合同约束
- 商铺产权人：若商铺为业主自有，电信公司需与业主签订租赁或使用合同，明确机房建设、维护及安全责任。合同中应约定用途限制（如不得改变建筑主体结构）、噪音控制等条款。
- 业主共有部分：若机房需占用公共区域（如屋顶、外墙），需经业主大会或业委会同意，并符合《民法典》第278条关于“改建、重建建筑物及其附属设施”的表决程序（需双三分之二业主参与且双四分之三同意）。
3. 环保与安全要求
- 电磁辐射：机房需符合《电磁环境控制限值》（GB 8702-2014），确保周边居民区电磁辐射强度低于标准限值。电信公司应委托专业机构检测并公示报告。
- 消防安全：机房需通过消防验收，配备灭火系统、应急照明等设施，并符合《建筑设计防火规范》（GB 50016）中关于通信机房的特殊要求。
- 噪音控制：机房设备运行噪音不得超过《社会生活环境噪声排放标准》（GB 22337-2008）规定的夜间限值（如住宅区为45分贝）。
4. 相邻权保护
- 法律依据：根据《民法典》第288条，不动产的相邻权利人应按照有利生产、方便生活、团结互助、公平合理的原则处理相邻关系。
- 实务要点：若机房建设导致业主通风、采光受影响，或产生噪音、辐射等侵害，业主可要求电信公司停止侵害、排除妨碍或赔偿损失。建议电信公司在建设前与周边业主沟通，签订补偿协议。
5. 地方性法规的特殊要求
- 示例：部分城市（如北京、上海）出台了《5G基站建设管理办法》，要求基站建设需同步纳入城市规划，并明确基站与居民区的最小距离（如北京规定为15米）。电信公司需遵守地方具体规定。
法律建议
- 对电信公司：建设前应全面核查商铺产权、规划用途及地方政策，确保手续齐全；与产权人、业主签订详细合同，明确权责；委托第三方进行环保、安全检测并公示结果。
- 对业主：若发现机房建设违法或侵害权益，可先向当地规划、环保部门投诉；若协商无果，可收集证据（如检测报告、合同）向法院起诉，要求停止侵害或赔偿。
提示：房产纠纷涉及地方政策差异较大，具体操作需结合当地法规。如有进一步疑问，可直接向我咨询，我会结合您所在城市的具体规定提供针对性建议。