被告在二审时发现原告在一审中提交了虚假材料，这种情况一般由二审法院进行管辖和处理。以下是详细分析：

1. 二审法院的管辖权：

   • 在民事诉讼中，二审法院负责审理对一审判决不服的上诉案件。当被告在二审阶段发现原告在一审中提交了虚假材料，这直接关系到一审判决的公正性和合法性，因此二审法院有权对此进行审查。
   • 二审法院在审查过程中，如果确认原告确实提交了虚假材料，且这些材料对一审判决产生了实质性影响，二审法院可以依法撤销原判，发回重审或者查清事实后改判。

2. 虚假材料的法律后果：

   • 提交虚假材料是严重的违法行为，不仅可能影响案件的公正审理，还可能损害对方的合法权益。根据《民事诉讼法》的相关规定，对于伪造、毁灭重要证据，妨碍人民法院审理案件的行为，人民法院可以根据情节轻重予以罚款、拘留；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
   • 在二审阶段发现虚假材料，二审法院除了可能撤销原判外，还可以对提交虚假材料的一方进行处罚，以维护诉讼秩序和司法公正。

3. 被告的应对措施：

   • 被告在二审阶段发现原告提交虚假材料后，应及时向二审法院提出异议，并提供相关证据证明原告提交的材料是虚假的。
   • 被告可以请求二审法院对虚假材料进行鉴定或调查，以确认其真实性。
   • 如果二审法院确认原告提交了虚假材料，被告可以依据二审法院的判决结果，进一步维护自己的合法权益。

4. 特殊情况下的处理：

   • 如果虚假材料的问题在一审阶段就已经存在，但一审法院未能发现或未予处理，被告在二审阶段提出后，二审法院应依法进行审查并作出相应处理。
   • 在某些情况下，如果虚假材料的问题非常严重，且可能涉及刑事犯罪，二审法院可能会将案件移送公安机关或检察机关进行刑事调查。

建议：

• 被告在二审阶段发现原告提交虚假材料后，应保持冷静，及时收集证据并向二审法院提出异议。
• 被告可以咨询专业律师（即向我咨询），以获取更具体的法律建议和帮助，确保自己的合法权益得到充分维护。