结论：被告在诉讼中更名，而法院调解仍使用被告原名字，一般情况下不会影响调解的效力，后期执行阶段通常也不会因此产生实质性障碍，但需注意及时办理相关手续以确保执行顺利进行。
调解阶段的影响
调解效力不受影响：
- 调解协议是基于双方当事人的真实意思表示达成的，只要被告在调解过程中确认了其身份（即使使用的是原名），且调解协议内容合法、自愿，那么调解协议的效力是不受影响的。
- 被告更名属于其个人身份信息的变更，并不影响其作为诉讼当事人的资格和调解协议的履行义务。
需注意的事项：
- 在调解过程中，如果可能的话，最好在调解协议中注明被告的曾用名和现用名，以避免未来可能出现的身份识别问题。
- 调解协议签署后，应及时向法院提交被告更名的相关证明文件，以便法院在调解书或判决书中准确记载被告的身份信息。
执行阶段的影响
执行依据的明确性：
- 执行阶段主要依据的是生效的法律文书（如调解书、判决书等）。只要法律文书中明确记载了被告的身份信息（包括原名和现用名，如果已注明的话），那么执行就不会受到实质性影响。
- 如果法律文书中仅记载了被告的原名，而被告在执行阶段已更名，那么执行法院可能会要求申请人提供被告更名的相关证明文件，以确认被执行人的身份。
可能遇到的障碍及解决：
- 障碍：如果申请人无法提供被告更名的相关证明文件，或者执行法院对被告的身份存在疑虑，那么执行可能会受到一定阻碍。
- 解决：申请人应及时向执行法院提交被告更名的相关证明文件（如户口本、身份证等），并说明情况。如果必要的话，还可以申请法院出具协助执行通知书，要求相关机构协助查询被告的身份信息。
实际操作建议：
- 在执行阶段开始前，申请人应尽可能收集并整理好被告的身份信息（包括原名和现用名），以及更名的相关证明文件。
- 如果发现法律文书中记载的被告身份信息与实际情况不符，应及时向执行法院提出更正申请，并提供相关证明文件。
总结与建议：被告在诉讼中更名，而法院调解仍使用被告原名字，一般情况下不会影响调解的效力和后期的执行。但为了确保执行的顺利进行，申请人应在执行阶段开始前做好充分的准备工作，包括收集并整理好被告的身份信息和更名的相关证明文件。如果遇到任何问题或疑虑，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。