结论：对方公司已注销后，原则上不能再为其开具发票，若强行开具可能涉及违法风险。不过，具体还需结合实际情况判断，以下为你详细分析。
法律背景与规定
从公司注销的法律后果来看，公司注销意味着其法人资格的终止。根据《中华人民共和国公司法》及相关规定，公司注销后，其民事权利能力和民事行为能力随之消灭，不再具有独立的法律主体地位，也就无法再以公司名义进行正常的经营活动，包括开具发票这一业务行为。
发票的开具是基于真实的业务交易，且由具有合法经营资格的主体进行。当公司注销后，它已经不具备开具发票的主体资格，所以从法律层面讲，不能再为其开具发票。
不同情况分析
- 若业务真实存在且未开具发票时公司尚未注销
- 如果在对方公司注销前，双方确实存在真实的业务往来，且当时由于各种原因未开具发票，理论上应该在公司注销前完成发票开具事宜。若在公司注销后才发现未开票，此时再开具发票就存在法律风险。因为公司注销后，其财务、税务等事项都应进行清算和结清，后续再开具发票可能会被税务机关认定为虚开发票等违法行为。
- 例如，A公司与B公司有货物销售业务，在B公司注销前，A公司一直未开具发票。B公司注销后，A公司若自行开具发票给B公司（此时B公司已不存在），这种行为就可能涉嫌违法。因为从税务角度看，无法核实该业务的真实性和合法性，也可能会影响税收征管秩序。
- 若业务存在争议或虚假
- 如果所谓的“业务”本身存在争议，或者实际上是虚假的业务，那么在公司注销后开具发票更是绝对不可以的。这不仅违反了发票管理的相关规定，还可能涉及虚开增值税专用发票、用于骗取出口退税、抵扣税款发票罪等刑事犯罪。
- 比如，双方为了套取税款，虚构了一笔业务，在公司注销后还试图开具发票，一旦被税务机关或司法机关查实，相关责任人将面临严厉的刑事处罚。根据《中华人民共和国刑法》第二百零五条规定，虚开增值税专用发票或者虚开用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处二万元以上二十万元以下罚金；虚开的税款数额较大或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金；虚开的税款数额巨大或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金或者没收财产。
法律建议
- 核实业务真实性：首先要仔细核实双方之间业务的真实性，收集相关的合同、交易记录、物流凭证等证据，以证明业务确实存在且合法。
- 与税务机关沟通：如果确实存在未开票的业务且情况特殊，建议及时与当地税务机关沟通，说明情况，按照税务机关的要求进行处理。税务机关会根据具体情况给出合理的指导和建议，避免因自行处理不当而引发法律风险。
- 谨慎处理发票事宜：在没有明确法律依据和税务机关指导的情况下，不要擅自为已注销的公司开具发票，以免给自己和公司带来不必要的法律麻烦。
如果你在处理这类问题时还有其他疑问，或者涉及到更复杂的法律情况，都可以直接向我咨询，我会结合具体情况为你提供更详细的法律分析和建议。