领导被查手机这一行为是否合法及如何处理，需分情况讨论，核心结论如下：

1. 若查手机行为发生在工作场景且符合公司规章制度
   若公司有明确规定（如员工手册中写明“为保障信息安全，公司有权对员工设备进行抽查”），且查手机范围仅限于工作相关内容（如工作群聊天记录、公司文件等），同时查手机前已履行告知义务（如提前通知员工或张贴公告），则该行为可能被认定为合法。
   处理建议：作为员工，可配合检查，但有权要求检查人员出示书面依据（如规章制度条款），并确认检查范围仅限工作内容。若对检查过程有异议（如检查人员翻看私人照片、聊天记录等），可当场提出并留存证据（如录音、录像），后续通过公司内部投诉渠道或劳动仲裁主张权利。

2. 若查手机行为涉及个人隐私且无法律或合同依据
   根据《民法典》第1032条，自然人享有隐私权，任何组织或个人不得以刺探、侵扰、泄露、公开等方式侵害他人隐私权。手机中的聊天记录、照片、视频等属于个人隐私范畴，若公司或领导未经员工同意擅自查看，可能构成侵权。
   处理建议：

   • 当场拒绝：明确告知对方“手机属于个人物品，未经同意不得查看”，并要求对方停止侵权行为；
     
   • 留存证据：若对方强行检查，可通过录音、录像、证人证言等方式固定证据；
     
   • 主张权利：向公司人力资源部门投诉，或直接向法院起诉要求停止侵害、赔礼道歉、赔偿损失（如因隐私泄露导致的精神损害赔偿）。

3. 若查手机行为与刑事调查相关
   若领导因涉嫌职务犯罪（如贪污、受贿等）被公安机关立案侦查，根据《刑事诉讼法》第138条，公安机关有权对与案件有关的物品进行查封、扣押、检查，包括手机。但需满足以下条件：

   • 公安机关已立案侦查；
     
   • 检查行为由两名以上侦查人员执行，并出示工作证件和搜查证（或扣押决定书）；
     
   • 检查范围限于与案件直接相关的内容（如行贿记录、赃款流向等）。
     处理建议：若领导被刑事调查，作为关联人员（如下属），可配合调查但有权要求侦查人员出示法律文书，并确认检查范围。若认为检查行为违法（如超范围检查、未出示文书等），可向公安机关督察部门投诉或申请复议。

总结：领导被查手机是否合法，需结合检查主体（公司/公安机关）、检查依据（规章制度/法律文书）、检查范围（工作/私人内容）综合判断。若认为自身权益受损，建议优先通过沟通、投诉解决，必要时通过法律途径维权。如有具体细节需要进一步分析，可直接向我咨询。