公司迟到扣款是否合法，需视具体情况而定。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
合法扣款的情况：
- 规章制度明确：如果公司的规章制度中明确规定了迟到扣款的条款，并且这些规章制度已经通过民主程序制定（如职工代表大会或全体职工讨论），同时已向劳动者公示或告知，那么这样的扣款是合法的。
- 扣款金额合理：扣款金额应当合理，不能过分高于劳动者因迟到给公司造成的实际损失。一般来说，扣款金额不应超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地的最低工资标准。
- 劳动合同约定：如果劳动合同中明确约定了迟到扣款的相关条款，且这些条款不违反法律法规的强制性规定，那么公司按照合同约定进行扣款也是合法的。
非法扣款的情况：
- 规章制度未公示或告知：如果公司的规章制度没有经过民主程序制定，或者没有向劳动者公示或告知，那么其中的迟到扣款条款对劳动者不具有约束力，公司因此进行的扣款是违法的。
- 扣款金额过高：如果公司扣款的金额过高，超过了劳动者当月工资的20%，或者扣除后的剩余工资低于当地的最低工资标准，那么这样的扣款也是违法的。
- 无规章制度或合同约定：如果公司没有制定相关的规章制度，或者劳动合同中没有约定迟到扣款的相关条款，那么公司无权对劳动者进行迟到扣款。
法律建议：
- 审查规章制度：如果你对公司是否合法扣款存在疑问，首先应当审查公司的规章制度，看其中是否有关于迟到扣款的明确规定，以及这些规定是否经过了民主程序制定并公示或告知。
- 核对劳动合同：同时，你也应当核对自己的劳动合同，看其中是否有关于迟到扣款的约定。
- 咨询专业意见：如果你对公司的扣款行为仍然存在疑问或不满，建议直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见和帮助。
可能法律后果：
- 如果公司非法扣款，劳动者有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求公司返还非法扣款的金额，并可能获得相应的赔偿。
- 公司如果因为非法扣款而面临劳动争议或诉讼，还可能承担额外的法律费用和声誉损失。
综上所述，公司迟到扣款是否合法取决于多种因素，包括规章制度的制定和公示情况、扣款金额的合理性以及劳动合同的约定等。如果你对此有疑问或不满，建议及时咨询专业律师以维护自己的合法权益。