结论：因感情破裂已经分居三年，法院在判决离婚时会将此作为重要参考因素，但并非仅凭分居三年就一定会判决离婚，还需结合其他因素综合判断。
法律背景与依据
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，夫妻双方因感情不和分居满二年，且经调解无效的，应准予离婚。这一规定明确了分居时间作为判决离婚的一个考量因素，但并非唯一因素。法院在判决离婚时，会综合考虑夫妻双方的感情状况、分居原因、分居期间是否履行夫妻义务、是否存在和好可能等多方面因素。
具体分析
分居时间：
- 您提到已经分居三年，这确实超过了法律规定的“分居满二年”的标准。然而，分居时间只是法院考虑的一个方面，并非决定性因素。
感情破裂的证据：
- 除了分居时间外，法院还会关注夫妻双方感情是否确实已经破裂。这通常需要提供证据来证明，如双方的书信、聊天记录、证人证言等，能够显示双方感情已经无法挽回。
调解情况：
- 在诉讼过程中，法院会进行调解，试图促使双方和好。如果调解无效，且法院认为双方感情确实已经破裂，才会判决离婚。
其他因素：
- 法院还会考虑分居期间双方是否履行了夫妻义务，如是否互相扶持、是否共同承担家庭责任等。如果分居期间双方已经完全断绝了夫妻关系，这也会作为法院判决离婚的参考因素。
法律建议
收集证据：
- 建议您积极收集能够证明双方感情已经破裂的证据，如分居期间的通信记录、证人证言等。这些证据将有助于法院更全面地了解双方的感情状况。
寻求调解：
- 在诉讼前或诉讼过程中，您可以尝试与对方进行调解，看是否能够达成和解。如果调解成功，可以避免诉讼的繁琐和费用。
准备诉讼材料：
- 如果调解无效，您需要准备充分的诉讼材料，包括起诉状、证据材料等，以便在法庭上充分陈述自己的诉求和理由。
咨询专业律师：
- 在整个过程中，如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。我会根据您的具体情况，为您提供专业的法律建议和帮助。
可能的法律后果
- 如果法院认为双方感情确实已经破裂，且调解无效，将会判决离婚。
- 如果法院认为双方感情尚未完全破裂，或者存在和好的可能，可能会判决不准离婚。在这种情况下，您可以在六个月后再次提起离婚诉讼。
总之，因感情破裂已经分居三年，法院在判决离婚时会将此作为重要参考因素，但并非仅凭此就一定会判决离婚。建议您积极收集证据，寻求调解，并准备充分的诉讼材料，以便在法庭上充分陈述自己的诉求和理由。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。