醉驾不予立案与免于起诉在后期纪委处理上确实存在区别，主要体现在处理阶段、处理依据以及处理结果上。以下是对这两者的详细分析：
一、处理阶段与性质
不予立案：
- 阶段：通常发生在刑事诉讼的初期，即公安机关或检察机关在接到报案、控告或举报后，经过审查认为不符合立案条件，因此决定不启动刑事诉讼程序。
- 性质：不予立案是对刑事诉讼程序启动的否定，意味着该行为在法律上未被认定为犯罪，或者虽然可能构成犯罪，但因情节轻微、证据不足等原因，决定不追究刑事责任。
免于起诉：
- 阶段：发生在刑事诉讼过程中，即检察机关在审查起诉阶段，认为犯罪嫌疑人的行为虽然构成犯罪，但根据法律规定或刑事政策，可以免予刑事处罚，因此决定不起诉。
- 性质：免于起诉是对犯罪嫌疑人刑事责任的免除，但并不意味着其行为不构成犯罪。它是对已经构成犯罪但情节轻微、社会危害性较小的行为的一种宽大处理。
二、处理依据
不予立案：
- 依据：主要依据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，如第一百一十二条关于立案条件的规定。公安机关或检察机关在审查报案、控告或举报时，会综合考虑行为的社会危害性、证据的充分性等因素，决定是否立案。
免于起诉：
- 依据：主要依据《中华人民共和国刑事诉讼法》中关于不起诉的规定，如第一百七十七条关于酌定不起诉的规定。检察机关在审查起诉时，会综合考虑犯罪嫌疑人的犯罪情节、悔罪表现、社会危害性等因素，决定是否免予起诉。
三、后期纪委处理
不予立案：
- 纪委处理：由于不予立案意味着行为在法律上未被认定为犯罪，因此纪委在处理时，通常会将其视为一般违纪行为或行政违法行为，根据党纪政纪规定进行相应处理。这种处理可能包括警告、记过、降级等行政处分，或者根据具体情况进行批评教育、诫勉谈话等。
免于起诉：
- 纪委处理：虽然免于起诉意味着犯罪嫌疑人的刑事责任被免除，但其行为仍然构成犯罪。因此，纪委在处理时，可能会将其视为严重违纪行为，根据党纪政纪规定进行更严厉的处理。这种处理可能包括撤销党内职务、留党察看、开除党籍等党纪处分，或者根据具体情况进行行政处罚、组织处理等。
四、实际案例与法律后果
不予立案案例：假设某人因醉驾被交警查获，但因其血液中酒精含量略低于醉驾标准，或者存在其他情节轻微的情况，公安机关决定不予立案。在此情况下，该人可能仅面临行政处罚，如罚款、吊销驾驶证等，而不会受到刑事追究。纪委在处理时，可能会根据具体情况给予相应的行政处分或批评教育。
免于起诉案例：假设某人因醉驾被检察机关审查起诉，但因其认罪态度好、积极赔偿损失、有悔罪表现等情节，检察机关决定免予起诉。在此情况下，该人虽然免除了刑事责任，但其行为仍然构成犯罪。纪委在处理时，可能会给予更严厉的党纪处分，如撤销党内职务或开除党籍等。
总结与建议：
醉驾不予立案与免于起诉在后期纪委处理上确实存在区别。不予立案通常意味着行为在法律上未被认定为犯罪，纪委处理相对较轻；而免于起诉则意味着行为虽然构成犯罪但情节轻微，纪委处理可能更为严厉。因此，在面对醉驾等违法行为时，建议当事人积极配合调查、认罪悔罪，并寻求专业法律帮助以维护自身权益。如果您或您身边的人遇到类似问题，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供详细的法律建议。