针对您提出的“有人在我楼顶违建应该起诉谁”的问题，我首先明确结论：您应当根据违建的具体实施主体和责任归属，来决定起诉的对象。 以下是我从不同角度为您进行的分析：
违建实施者：
- 如果违建是由某个具体的个人或单位直接在您的楼顶上建造的，那么您首先应当考虑起诉该违建的实施者。他们未经您的同意，擅自占用您的楼顶空间进行违建，侵犯了您的物权，特别是使用权和收益权。
- 在起诉时，您需要提供充分的证据证明违建的存在以及违建实施者的身份，如现场照片、视频、证人证言等。
物业或管理方：
- 如果违建发生在您所在的小区或建筑物内，且物业或管理方未能履行其管理职责，导致违建得以发生或持续存在，那么您也可以考虑将物业或管理方作为共同被告或单独被告进行起诉。
- 物业或管理方有责任维护小区的公共秩序和建筑物安全，包括防止违建的发生。如果他们未能尽到这一责任，就应当承担相应的法律责任。
- 在起诉物业或管理方时，您需要证明他们存在管理疏忽或失职行为，以及这种行为与违建发生之间的因果关系。
相关政府部门：
- 在某些情况下，违建可能得到了相关政府部门的默许或支持，或者政府部门在违建发生后未能及时采取措施进行制止和拆除。虽然直接起诉政府部门的情况较为少见，但在某些特定情境下，如政府部门的不作为或违法行政行为导致您的权益受损，您也可以考虑通过行政诉讼等途径来维护自己的权益。
- 不过，通常情况下，您更可能的是通过投诉、举报等方式要求政府部门履行其职责，对违建进行查处和拆除。
法律建议：
- 在决定起诉之前，我建议您先尝试与违建实施者、物业或管理方进行沟通协商，看是否能够通过和平方式解决问题。
- 如果沟通协商无果，您可以考虑向相关部门（如城市管理部门、规划部门等）进行投诉举报，要求他们依法对违建进行查处和拆除。
- 如果上述途径均无法解决问题，您再考虑通过法律途径来维护自己的权益。在起诉时，请务必准备好充分的证据来支持您的主张。
可能法律后果：
- 如果您能够成功起诉违建实施者或物业/管理方，并获得法院的支持，那么违建可能会被要求拆除，同时您也可能获得相应的赔偿（如因违建导致的损失、维权成本等）。
- 如果起诉政府部门并获得支持，政府部门可能会被要求履行其职责，对违建进行查处和拆除，并可能对相关责任人员进行问责。
希望以上分析能够对您有所帮助。如果您在处理此类问题时遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。