关于借款合同超过三年后在合同后再次签订是否有效的问题，结论是：这取决于具体情况，包括原合同的诉讼时效状态、新合同的签订目的及内容等。以下从不同角度进行分析：

1. 诉讼时效的角度：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，民间借贷的诉讼时效一般为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。如果原借款合同已经超过三年诉讼时效，且在此期间债权人未向债务人主张过权利，那么原债权可能因诉讼时效届满而失去法律保护。
   • 若在此情况下再次签订合同：这可以被视为双方对原债务的重新确认，或者是一个新的借贷关系的建立。如果新合同明确约定了新的还款期限、利息等条款，且双方意思表示真实，不违反法律、行政法规的强制性规定，那么新合同是有效的。但需要注意的是，新合同的签订并不自动恢复原债权因诉讼时效届满而失去的法律保护力，除非债务人明确表示愿意履行原债务。

2. 合同内容与目的的角度：

   • 如果新合同是对原合同的补充或修改：例如，双方同意延长还款期限、调整利息等，且这些修改不违反法律、行政法规的强制性规定，那么新合同是有效的。这种情况下，新合同的签订实际上是对原合同权利义务的变更或补充。
   • 如果新合同是一个全新的借贷关系：即双方基于新的借贷意愿和条件签订了合同，那么新合同的有效性将独立于原合同。只要新合同符合法律规定的合同成立要件，就是有效的。

3. 法律建议：

   • 在签订任何合同之前，建议双方都仔细阅读合同条款，确保理解并同意其中的内容。特别是关于还款期限、利息、违约责任等关键条款，应当明确无误。
   • 如果原借款合同已经超过诉讼时效，且债权人希望继续追讨债务，建议在签订新合同之前咨询专业律师，了解相关法律风险和可能的法律后果。
   • 在签订新合同时，可以考虑加入一些条款来明确双方的权利义务，以及新合同与原合同的关系，以避免未来可能出现的纠纷。

总结来说，借款合同超过三年后在合同后再次签订是否有效，取决于多种因素，包括原合同的诉讼时效状态、新合同的签订目的及内容等。如果双方意思表示真实，且新合同不违反法律、行政法规的强制性规定，那么新合同是有效的。但具体情况还需具体分析，如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。