结论前置：员工持有医院开具的合法病假条时，公司原则上应当予以批准。若公司无正当理由拒绝批准，则可能构成对员工合法权益的侵犯，员工有权通过法律途径维护自身权益。
一、公司不批病假条的合法性分析
员工病假权利：
- 根据我国《劳动法》及《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》等相关法律法规，员工因病或非因工负伤需要停止工作进行医疗时，享有相应的医疗期。在此期间，公司应给予员工病假，并支付病假工资或疾病救济费。
病假条的合法性要求：
- 员工提交的病假条必须真实有效，需加盖医院公章、有医生真实签名，并且病历和病假条能够相互印证。只有符合这些要求的病假条，公司才应予以批准。
公司不批病假条的合法性：
- 若员工提交的病假条符合上述合法性要求，公司无正当理由拒绝批准，则构成对员工合法权益的侵犯。公司可能因此面临法律后果，如违法解除劳动合同的赔偿金支付、拖欠工资的补发等。
二、公司不批病假条的应对措施
沟通协商：
- 员工应首先与直接上级领导或人力资源部门进行友好沟通，详细说明病情及医生建议休假的必要性，并提供病历、检查报告等相关证明材料。尝试与公司协商调整工作任务或请假时间，如先请部分病假或通过远程办公等方式完成工作任务。
寻求调解与帮助：
- 若协商无果，员工可向基层人民调解组织、企业劳动争议调解委员会或具有劳动争议调解职能的组织申请调解。如公司设有工会组织，也可向工会反映情况，寻求其帮助协调。
劳动监察投诉：
- 若调解仍未能解决问题，员工可向当地劳动监察部门投诉，要求其对公司的违法行为进行监督检查并责令改正。
申请劳动仲裁：
- 在上述方法均无效时，员工可向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司批准病假并支付病假期间的工资待遇。仲裁时需提供充分证据支持诉求，如病假条、病历、检查报告等。
提起诉讼：
- 如对仲裁裁决不服，员工可依法向人民法院提起诉讼，通过司法程序维护自己的合法权益。
三、特殊情况下的病假处理
虽然员工依法享有休病假的权利，但在某些特定情况下，公司可能与员工协商适当延缓病假开始时间。这通常发生在以下情形：
- 企业面临重大项目交付、突发事件应急处理等紧急且必要的工作任务；
- 员工所处岗位暂时无人替代，且员工的病情并非十分危急。
然而，这种情况下公司应与员工进行充分沟通，并取得员工的理解。任何对病假申请的延迟处理都应基于双方协商一致的基础上，且不得损害员工的合法权益。
四、法律建议
保留证据：
- 员工应妥善保管好医院出具的病假条、诊断证明等相关材料，作为日后维权的重要证据。
依法维权：
- 在面对公司不批病假的情况时，员工应依法维权，避免采取过激行为。通过沟通协商、调解、投诉、仲裁或诉讼等法律途径来维护自己的合法权益。
了解公司规章制度：
- 员工在请病假前，应了解公司的规章制度和请假流程，确保按照公司规定提交合法的病假证明材料。
综上所述，员工持有医院开具的合法病假条时，公司原则上应当予以批准。若公司无正当理由拒绝批准，员工有权通过法律途径维护自身权益。在处理此类问题时，员工应保留好相关证据，并依法进行维权。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。