结论：合同期内因丈量土地面积增加而额外收费是否合理，需结合合同约定、实际履行情况及法律规定综合判断，具体分以下两种情况分析：

1. 若合同明确约定“按实际丈量面积收费”

• 合理性分析：若合同中已写明“承包费用按最终实际丈量面积计算”，且双方在签订时对丈量结果无异议，则合同期内因面积增加而补缴费用具有合同依据，属于合理要求。
• 例外情形：若面积增加是由于发包方（如村委会）前期丈量错误导致，且承包方无过错（如未隐瞒土地边界），则承包方可主张免除补缴责任，或要求发包方承担部分责任。

2. 若合同未明确约定面积调整条款

• 法律原则：根据《民法典》第五百四十三条，合同变更需双方协商一致。若合同仅约定“三年一次交费”但未提及面积调整，发包方单方面要求补缴费用可能构成违约。
• 例外情形：若面积增加是由于不可抗力（如自然灾害导致土地边界变化）或政府行为（如土地征收、规划调整），双方可协商变更合同；若协商不成，承包方可拒绝补缴，但需保留相关证据（如政府文件、丈量记录）。

操作建议

1. 核查合同条款：重点查看是否有“面积调整”“费用变更”等约定，以及丈量程序是否合法（如是否由双方共同参与、是否有书面确认）。
2. 固定证据：若发包方主张面积增加，要求其提供合法丈量报告（如由第三方机构出具），并核对与原合同面积的差异。
3. 协商或诉讼：若发包方坚持收费且无合法依据，承包方可先协商解决；协商不成，可向农村土地承包仲裁委员会申请仲裁，或直接向法院起诉要求确认合同效力。

提示：土地承包纠纷涉及地方政策差异，建议结合当地具体规定进一步分析。如有疑问，可直接向我提供合同文本或详细情况，我会为您进一步解答。