员工工作三个月后能否预支工资，需分情况讨论，具体如下：

1. 劳动合同或公司制度有明确约定
   若劳动合同中明确约定了预支工资的条件、流程（如预支比例、审批程序等），或公司规章制度中对此有具体规定，员工可依据约定申请预支。例如，合同约定“工作满3个月可预支1个月工资”，则员工有权主张。

2. 劳动合同或公司制度无约定，但公司同意预支
   即使无书面约定，若公司基于员工实际困难（如突发疾病、家庭变故等）口头同意预支，双方可形成临时协议。此时需注意保留沟通记录（如微信、邮件）或书面确认，避免后续纠纷。

3. 劳动合同或公司制度禁止预支，或公司拒绝
   若公司明确禁止预支工资，或员工未满足内部条件（如未通过试用期），则公司有权拒绝。此时员工不可强制要求预支，但可通过其他途径解决资金需求（如申请借款、协商分期支付等）。

法律风险提示：

• 预支工资本质是“提前发放未来劳动报酬”，需以员工继续提供劳动为前提。若预支后员工离职，公司可能要求返还超额部分（如预支2个月工资但仅工作1个月）。
  
• 若公司以“预支工资”名义变相克扣或拖欠工资（如要求员工先支付“押金”再预支），可能涉嫌违反《劳动合同法》第9条、第30条，员工可向劳动监察部门投诉或申请仲裁。

建议行动：

1. 优先查阅劳动合同、员工手册或与公司协商，明确预支规则；
   
2. 若需预支，建议以书面形式确认金额、还款方式（如从后续工资扣除）及离职处理条款；
   
3. 若公司拒绝且存在拖欠工资行为，可收集考勤、工资条等证据，通过法律途径维权。
   

如有具体合同条款或公司政策需要分析，可进一步提供细节，我会为您详细解答。