针对非营运面包车超员两人的处罚，主要依据超员比例以及相关法律法规来确定。以下是对此问题的详细解析：

1. 超员比例计算与处罚：

   • 假设面包车的核定载客人数为7人，超员两人则实载9人，超员比例约为28.6%（2/7≈0.286，即28.6%）。
   • 根据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条及《道路交通安全违法行为记分管理办法》的相关规定，非营运面包车超员20%以上未达50%的，将处警告或者二十元以上二百元以下罚款，并记3分。

2. 具体处罚措施：

   • 罚款：根据超员情况，交警部门将依据《中华人民共和国道路交通安全法》第九十条，对面包车驾驶人处以警告或者二十元以上二百元以下的罚款。
   • 记分：同时，根据《道路交通安全违法行为记分管理办法》，驾驶非营运面包车超员20%以上未达50%的，将一次记3分。

3. 其他注意事项：

   • 超载乘客转运：无论处罚如何，超员时都必须对超载的乘客进行转运，以确保道路交通安全，消除安全隐患。
   • 行车安全重要性：车辆超员会严重影响行车安全，增加事故风险。驾驶人应严格遵守交通法规，确保车辆不超员，以保障自身和他人的生命安全。
   • 法律责任明确：面包车超员的处罚是严格的，不仅涉及罚款和记分，还可能面临其他法律责任。因此，驾驶人应提高法律意识，遵守相关规定。

实际案例说明： 假设某驾驶人驾驶一辆核定载客7人的非营运面包车，在行驶过程中被交警查获实载9人。交警部门将依据上述法律法规，对该驾驶人处以警告或者二十元以上二百元以下的罚款，并记3分。同时，要求驾驶人立即转运超载的乘客，以确保道路交通安全。

总结与建议： 非营运面包车超员两人属于违法行为，将受到法律的严格处罚。驾驶人应严格遵守交通法规，按照车辆核定人数载客，确保行车安全。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将竭诚为你服务。